RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227520.9

CCDC86-201, Transcript of coiled-coil domain containing 86, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC86, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86-201ENST00000227520 TRIM47Q96LD4 638 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 PAGR1Q9BTK6 254 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 TMEM60Q9H2L4 133 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 DISC1Q9NRI5 854 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 FBXO28Q9NVF7 368 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 DOCK3Q8IZD9 2030 aa15.87■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 CNMDO75829 334 aa15.87■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 FLOT1O75955 427 aa15.87■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 GYPCP04921 128 aa15.87■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 CASP14P31944 242 aa15.87■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 COPB1P53618 953 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 KIF22Q14807 665 aa15.87■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 INF2Q27J81 1249 aa15.87■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 CNGA4Q8IV77 575 aa15.87■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 KRT222Q8N1A0 295 aa15.87■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 EFCC1Q9HA90 598 aa15.87■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 RBPJLQ9UBG7 517 aa15.87■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 GDAQ9Y2T3 454 aa15.87■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 HTTP42858 3142 aa15.87■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 KCNJ18B7U540 433 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 N4BP3O15049 544 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 TPM1P09493 284 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 PRCPP42785 496 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 PSMC4P43686 418 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 CLCN6P51797 869 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 KCNJ12Q14500 433 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 COG2Q14746 738 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 NAALADL2Q58DX5 795 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 TCP11X2Q5H9J9 407 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 SLFN13Q68D06 897 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 SPZ1Q9BXG8 430 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 CCSER1Q9C0I3 900 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 PRDM4Q9UKN5 801 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 MRFAP1Q9Y605 127 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 KLRF2D3W0D1 207 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 LAD1O00515 517 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 PRPHP41219 470 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 LBX2Q6XYB7 198 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 ADSSL1Q8N142 457 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 ATG4CQ96DT6 458 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 VPS16Q9H269 839 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 TAB2Q9NYJ8 693 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 BTBD7Q9P203 1132 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 MTMR7Q9Y216 660 aa15.86■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 PP2D1A8MPX8 630 aa15.85■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 ERVK-9P63128 1117 aa15.85■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 ERVK-24P63145 666 aa15.85■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 KCNB1Q14721 858 aa15.85■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 Q3C1V9 767 aa15.85■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 MYPNQ86TC9 1320 aa15.85■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 MYL1P05976 194 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 GOLGA8HP0CJ92 632 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 SMARCA1P28370 1054 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 DSG3P32926 999 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 UBA7P41226 1012 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 FCGRTP55899 365 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 PPP2R3AQ06190 1150 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 SEMA3FQ13275 785 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 TRIM14Q14142 442 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 ZMYND12Q9H0C1 365 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 KBTBD4Q9NVX7 518 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 KLRC4O43908 158 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 KRT25Q7Z3Z0 450 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 IRF2BP1Q8IU81 584 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 TMTC1Q8IUR5 882 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 RASSF8Q8NHQ8 419 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 GMCL1Q96IK5 515 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 PORCNQ9H237 461 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 LZTFL1Q9NQ48 299 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa15.84■□□□□ 0.13
CCDC86-201ENST00000227520 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CCDC86-201ENST00000227520 BMP3P12645 472 aa15.83■□□□□ 0.12
CCDC86-201ENST00000227520 NAPAP54920 295 aa15.83■□□□□ 0.12
CCDC86-201ENST00000227520 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
CCDC86-201ENST00000227520 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CCDC86-201ENST00000227520 SLF1Q9BQI6 1058 aa15.83■□□□□ 0.12
CCDC86-201ENST00000227520 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
CCDC86-201ENST00000227520 HOXC10Q9NYD6 342 aa15.83■□□□□ 0.12
CCDC86-201ENST00000227520 PTPN22Q9Y2R2 807 aa15.83■□□□□ 0.12
CCDC86-201ENST00000227520 A0A0U1RQJ8 604 aa15.82■□□□□ 0.12
CCDC86-201ENST00000227520 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CCDC86-201ENST00000227520 RHOBTB3O94955 611 aa15.82■□□□□ 0.12
CCDC86-201ENST00000227520 SLC1A4P43007 532 aa15.82■□□□□ 0.12
CCDC86-201ENST00000227520 ARHGEF6Q15052 776 aa15.82■□□□□ 0.12
CCDC86-201ENST00000227520 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms