RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220429.12

GABPB1-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1, Length 2,726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-201ENST00000220429 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
GABPB1-201ENST00000220429 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
GABPB1-201ENST00000220429 PCMTD2Q9NV79 361 aa14.96□□□□□ -0.01
GABPB1-201ENST00000220429 CEP131Q9UPN4 1083 aa14.96□□□□□ -0.01
GABPB1-201ENST00000220429 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.96□□□□□ -0.01
GABPB1-201ENST00000220429 CLTAP09496 248 aa14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 GYS1P13807 737 aa14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 GPSM2P81274 684 aa14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 USP49Q70CQ1 688 aa14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 TNFRSF25Q93038 417 aa14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 TRIM7Q9C029 511 aa14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 WNT7AO00755 349 aa14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 TMEM62Q0P6H9 643 aa14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 CERKQ8TCT0 537 aa14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ASB3Q9Y575 518 aa14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 TRIM75PA6NK02 468 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 N4BP3O15049 544 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 PPIP5K2O43314 1243 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 NPTXRO95502 500 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 KRT14P02533 472 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 BMP6P22004 513 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 KIF5BP33176 963 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 GNAQP50148 359 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 DEUP1Q05D60 604 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 MPP3Q13368 585 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 CRY2Q49AN0 593 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 CCDC70Q6NSX1 233 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 CSRNP2Q9H175 543 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 SAR1BQ9Y6B6 198 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 GMNCA6NCL1 334 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 CCT6BQ92526 530 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ZIM3Q96PE6 472 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 PHF24Q9UPV7 400 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 PPP4CP60510 307 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 TFAP4Q01664 338 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 SFMBT2Q5VUG0 894 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 HINFPQ9BQA5 517 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 NDST4Q9H3R1 872 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ZWILCHQ9H900 591 aa14.94□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ENC1O14682 589 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 SERPINB2P05120 415 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ZNF24P17028 368 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 POSTNQ15063 836 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 CCDC63Q8NA47 563 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 C17orf50Q8WW18 174 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 PANK4Q9NVE7 773 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 SRGAP2O75044 1071 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 UFL1O94874 794 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 GSTO1P78417 241 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 CD209Q9NNX6 404 aa14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 MAP3K13O43283 966 aa14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 SCG2P13521 617 aa14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 EPHB4P54760 987 aa14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 RBL2Q08999 1139 aa14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 QPCTQ16769 361 aa14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 MAN1B1Q9UKM7 699 aa14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 BAG3O95817 575 aa14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 CCND1P24385 295 aa14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 NT5DC1Q5TFE4 455 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms