RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)N

tL(CAA)N, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tL(CAA)N, Length 82 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tL(CAA)NtL(CAA)N CDC36P06100 191 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N DAT1P13483 248 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N SAC7P17121 654 aa3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N PHO13P19881 312 aa3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N AAD3P25612 363 aa3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N ARE1P25628 610 aa3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N CMK1P27466 446 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N RPB9P27999 122 aa3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data3.43□□□□□ -1.86not detected
tL(CAA)NtL(CAA)N PTM1P32857 523 aa3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N GLG1P36143 616 aa3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N MUP3P38734 546 aa3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N MEP1P40260 492 aa3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N CAB2P40506 365 aa3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N FKH2P41813 862 aa3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N ALB1P47019 175 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N STR2P47164 639 aa3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N BOL2P53082 120 aa3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N LSM3P57743 89 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N PLM2Q04383 521 aa3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N BCH1Q05029 724 aa3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N HRI1Q05905 244 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N MLH3Q12083 715 aa3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N TAD3Q9URQ3 322 aa3.43□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N COX6P00427 148 aa3.42□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N ARD1P07347 238 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N HIR2P32480 875 aa3.42□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N YKL102CP34249 101 aa3.42□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N NUP120P35729 1037 aa3.42□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N SNU114P36048 1008 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N YKR078WP36158 585 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N APD1P38281 316 aa3.42□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N MTC4P38335 694 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N MTC6P38849 526 aa3.42□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N EMP65P40085 556 aa3.42□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N YMR134WP40207 237 aa3.42□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N ATP22P50273 684 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N TPC1P53257 314 aa3.42□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N ATP25Q03153 612 aa3.42□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N YLL007CQ07799 665 aa3.42□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N PML1Q07930 204 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N YER145C-AA0A023PYF4 145 aa3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N RAD1P06777 1100 aa3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N CBP6P07253 162 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N YAP1P19880 650 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N HSP60P19882 572 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N NFS1P25374 497 aa3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N OXP1P28273 1286 aa3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N TPO5P36029 618 aa3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N ARL1P38116 183 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N YBR071WP38243 211 aa3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N MGE1P38523 228 aa3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N RCK2P38623 610 aa3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data3.41□□□□□ -1.86not detected
tL(CAA)NtL(CAA)N HAT2P39984 401 aa3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N AVT7P40501 490 aa3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N GPP1P41277 250 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N BTN2P53286 410 aa3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N GIP3Q03016 1276 aa3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N SDC1Q03323 175 aa3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N SPO20Q04359 397 aa3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N CDC123Q05791 360 aa3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N PIN3Q06449 215 aa3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N ATG23Q06671 453 aa3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N MHT1Q12525 324 aa3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N YOR019WQ99248 730 aa3.41□□□□□ -1.86
tL(CAA)NtL(CAA)N PET111P08468 800 aa3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N ARF1P11076 181 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N ERD1P16151 362 aa3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N RAD57P25301 460 aa3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N IDH2P28241 369 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N URA10P30402 227 aa3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N FUN30P31380 1131 aa3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N DBF20P32328 564 aa3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N BCK2P33306 851 aa3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data3.4□□□□□ -1.87not detected
tL(CAA)NtL(CAA)N IFA38P38286 347 aa3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N MSG5P38590 489 aa3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N PRS3P38689 320 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N AST2P39945 430 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N YNL208WP40159 199 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N SLZ1P40167 298 aa3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N UPF3P48412 387 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N RNR4P49723 345 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N KEL2P50090 882 aa3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N YGR066CP53242 292 aa3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N MNT4P53745 580 aa3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N YNL260CP53846 198 aa3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N ADH6Q04894 360 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N ISR1Q06098 443 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N YLR446WQ06204 433 aa3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N RIF2Q06208 395 aa3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N DAS2Q12084 232 aa3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N SKS1Q12505 502 aa3.4□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N RPL15AP05748 204 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N MET2P08465 486 aa3.39□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N YHR214C-DP0CX93 97 aa3.39□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N TFS1P14306 219 aa3.39□□□□□ -1.87
tL(CAA)NtL(CAA)N SRB4P32569 687 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.2 ms