RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C CDC36P06100 191 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C DAT1P13483 248 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C SAC7P17121 654 aa3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C PHO13P19881 312 aa3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C AAD3P25612 363 aa3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C ARE1P25628 610 aa3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C CMK1P27466 446 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C RPB9P27999 122 aa3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data3.43□□□□□ -1.86not detected
SUP53tL(CAA)C PTM1P32857 523 aa3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C GLG1P36143 616 aa3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C MUP3P38734 546 aa3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C MEP1P40260 492 aa3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C CAB2P40506 365 aa3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C FKH2P41813 862 aa3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C ALB1P47019 175 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C STR2P47164 639 aa3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C BOL2P53082 120 aa3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C LSM3P57743 89 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C PLM2Q04383 521 aa3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C BCH1Q05029 724 aa3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C HRI1Q05905 244 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C MLH3Q12083 715 aa3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C TAD3Q9URQ3 322 aa3.43□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C COX6P00427 148 aa3.42□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C ARD1P07347 238 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C HIR2P32480 875 aa3.42□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C YKL102CP34249 101 aa3.42□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C NUP120P35729 1037 aa3.42□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C SNU114P36048 1008 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C YKR078WP36158 585 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C APD1P38281 316 aa3.42□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C MTC4P38335 694 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C MTC6P38849 526 aa3.42□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C EMP65P40085 556 aa3.42□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C YMR134WP40207 237 aa3.42□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C ATP22P50273 684 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C TPC1P53257 314 aa3.42□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C ATP25Q03153 612 aa3.42□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C YLL007CQ07799 665 aa3.42□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C PML1Q07930 204 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C YER145C-AA0A023PYF4 145 aa3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C RAD1P06777 1100 aa3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C CBP6P07253 162 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C YAP1P19880 650 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C HSP60P19882 572 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C NFS1P25374 497 aa3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C OXP1P28273 1286 aa3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C TPO5P36029 618 aa3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C ARL1P38116 183 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C YBR071WP38243 211 aa3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C MGE1P38523 228 aa3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C RCK2P38623 610 aa3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data3.41□□□□□ -1.86not detected
SUP53tL(CAA)C HAT2P39984 401 aa3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C AVT7P40501 490 aa3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C GPP1P41277 250 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C BTN2P53286 410 aa3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C GIP3Q03016 1276 aa3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C SDC1Q03323 175 aa3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C SPO20Q04359 397 aa3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C CDC123Q05791 360 aa3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C PIN3Q06449 215 aa3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C ATG23Q06671 453 aa3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C MHT1Q12525 324 aa3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C YOR019WQ99248 730 aa3.41□□□□□ -1.86
SUP53tL(CAA)C PET111P08468 800 aa3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C ARF1P11076 181 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C ERD1P16151 362 aa3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C RAD57P25301 460 aa3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C IDH2P28241 369 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C URA10P30402 227 aa3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C FUN30P31380 1131 aa3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C DBF20P32328 564 aa3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C BCK2P33306 851 aa3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data3.4□□□□□ -1.87not detected
SUP53tL(CAA)C IFA38P38286 347 aa3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C MSG5P38590 489 aa3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C PRS3P38689 320 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C AST2P39945 430 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C YNL208WP40159 199 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C SLZ1P40167 298 aa3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C UPF3P48412 387 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C RNR4P49723 345 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C KEL2P50090 882 aa3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C YGR066CP53242 292 aa3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C MNT4P53745 580 aa3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C YNL260CP53846 198 aa3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C ADH6Q04894 360 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C ISR1Q06098 443 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C YLR446WQ06204 433 aa3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C RIF2Q06208 395 aa3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C DAS2Q12084 232 aa3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C SKS1Q12505 502 aa3.4□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C RPL15AP05748 204 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C MET2P08465 486 aa3.39□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C YHR214C-DP0CX93 97 aa3.39□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C TFS1P14306 219 aa3.39□□□□□ -1.87
SUP53tL(CAA)C SRB4P32569 687 aa3.39□□□□□ -1.87
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