RNA–Protein interactions for RNA: YMR054W

STV1, Transcript of Subunit a of the vacuolar-ATPase V0 domain, yeast

Gene STV1, Length 2,673 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STV1	YMR054W	YUR1	P26725	428 aa		4.11	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	PSO2	P30620	661 aa		4.11	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	HXT1	P32465	570 aa		4.11	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	FRE1	P32791	686 aa		4.11	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	DIA3	P52290	468 aa		4.11	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	ROG1	P53118	685 aa		4.11	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	YGR117C	P53270	476 aa		4.11	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	IPK1	Q06667	281 aa		4.11	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	POS5	Q06892	414 aa		4.11	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	RDR1	Q08904	546 aa		4.11	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	BAG7	Q12128	409 aa		4.11	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
STV1	YMR054W	SWM1	Q12379	170 aa		4.11	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	APC2	Q12440	853 aa		4.11	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	SLX1	P38324	304 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	UIP3	P39547	235 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	YFR020W	P43600	232 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	CTH1	P47976	325 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	YGL108C	P53139	140 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	URH1	Q04179	340 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	INP53	Q12271	1107 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	PET111	P08468	800 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	CNA1	P23287	553 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	EMP70	P32802	667 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	RPC34	P32910	317 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	ARP1	P38696	384 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	PTC7	P38797	343 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	RCY1	P39531	840 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	ECM10	P39987	644 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	YFL066C	P43538	392 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	SNG1	P46950	547 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	NRG1	Q03125	231 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	WAR1	Q03631	944 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	RSM24	Q03976	319 aa		4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	GID7	P25569	745 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	BEM1	P29366	551 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	STP2	P38704	541 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	YHR122W	P38829	231 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	TOS3	P43637	560 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	ATG27	P46989	271 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	TAX4	P47030	604 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	MPS3	P47069	682 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	GSH1	P32477	678 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	SPR1	P32603	445 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	GMH1	P36125	273 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	SAF1	P38352	637 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	ATM1	P40416	690 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	YRB2	P40517	327 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	CGR1	P53188	120 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	MED2	Q12124	431 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	MED4	Q12343	284 aa		4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STV1	YMR054W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STV1	YMR054W	CDC15	P27636	974 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STV1	YMR054W	KRE2	P27809	442 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STV1	YMR054W	CWP1	P28319	239 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STV1	YMR054W	SIN4	P32259	974 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STV1	YMR054W	PPS1	P38148	807 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STV1	YMR054W	DUG2	P38149	878 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STV1	YMR054W	FAR3	P46671	204 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STV1	YMR054W	YAR1	P46683	200 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STV1	YMR054W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STV1	YMR054W	CTS2	Q06350	511 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STV1	YMR054W	BSC6	Q08280	497 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STV1	YMR054W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STV1	YMR054W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STV1	YMR054W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76

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