RNA–Protein interactions for RNA: YKL038W

RGT1, Transcript of Glucose-responsive transcription factor, yeast

Gene RGT1, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGT1	YKL038W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	SLY41	P22215	453 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	ATP7	P30902	174 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	ISF1	P32488	338 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	SRY1	P36007	326 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	SUL1	P38359	859 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	EFM1	P38732	585 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	CYC2	P38909	366 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	UBP9	P39967	754 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	KTR7	P40504	517 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	TIM54	P47045	478 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	FOL1	P53848	824 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	HSP31	Q04432	237 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	ATG20	Q07528	640 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	LAP2	Q10740	671 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	FLP1	P03870	423 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	ADE8	P04161	214 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.21	□□□□□ -1.58	not detected
RGT1	YKL038W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	TUL1	P36096	758 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	YBL029W	P38201	376 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	YPL071C	Q02864	156 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	PRM6	Q04705	352 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	NEJ1	Q06148	342 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	NUT2	Q06213	157 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	YLR173W	Q06247	608 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	OPT2	Q06593	877 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	YLR464W	P0CX17	216 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	MAS2	P11914	482 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	CDC20	P26309	610 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	NDC1	P32500	655 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	PTM1	P32857	523 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	CAF4	P36130	643 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	BMT2	P38278	337 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	YEL076C	P39971	216 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	MCM22	P47167	239 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	INN1	P53901	409 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	YPL107W	Q02873	248 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	RAD34	Q06665	692 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	YFT2	Q06676	274 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	SRB6	P32570	121 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	ERT1	P38140	529 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	YIL166C	P40445	542 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	HCH1	P53834	153 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	INM2	Q05533	292 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	YDL057W	Q07379	328 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	FMP25	Q08023	583 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	REP2	P03872	296 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	CIT2	P08679	460 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	PCK1	P10963	549 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	ADE1	P27616	306 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	SCM4	P32564	187 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	ISC10	P32645	267 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	SSS1	P35179	80 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	SNN1	P48232	102 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	MRH4	P53166	561 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	TRM12	Q04235	462 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	YDR018C	Q12185	396 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	YOL107W	Q12239	342 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	PHM7	Q12252	991 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	MED1	Q12321	566 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	GPM3	Q12326	303 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	LDB19	Q12502	818 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	PDC2	P32896	925 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	SRB2	P34162	210 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	NVJ1	P38881	321 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	MNN1	P39106	762 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	THI6	P41835	540 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	YFL012W	P43580	148 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	TOM22	P49334	152 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	UBC12	P52491	188 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	YBP2	P53169	641 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	TUB4	P53378	473 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	GRS2	Q06817	618 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	SSP2	Q08646	371 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	NYV1	Q12255	253 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	MHF1	Q3E835	90 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	PMD1	P32634	1753 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	FTH1	P38310	465 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RGT1	YKL038W	RBG1	P39729	369 aa		5.19	□□□□□ -1.58

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