RNA–Protein interactions for RNA: YJL059W

YHC3, Transcript of Protein required for the ATP-dependent transport of arginine, yeast

Gene YHC3, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHC3	YJL059W	GLE1	Q12315	538 aa		6.59	□□□□□ -1.35
YHC3	YJL059W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
YHC3	YJL059W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		6.59	□□□□□ -1.35
YHC3	YJL059W	SPS4	P09937	338 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	YMR085W	P0CF18	432 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	ERG11	P10614	530 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	MRP13	P12686	339 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	PEP5	P12868	1029 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	SPR1	P32603	445 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	YKL071W	P36086	256 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	TOM22	P49334	152 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	YGR127W	P53275	312 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	EFM6	P53970	246 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	YDR541C	Q03049	344 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	BNA7	Q04066	261 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	UFO1	Q04511	668 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	STE23	Q06010	1027 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	NDL1	Q06568	189 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	YOS9	Q99220	542 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	PMR1	P13586	950 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	ATP11	P32453	318 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	ECM25	P32525	599 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	MNN2	P38069	597 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	MAL32	P38158	584 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	MSR1	P38714	643 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	MAL12	P53341	584 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	RTC4	P53850	401 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	YNL146W	P53906	100 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	USA1	Q03714	838 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	EKI1	Q03764	534 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	ARR3	Q06598	404 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.57	□□□□□ -1.36	not detected
YHC3	YJL059W	PMD1	P32634	1753 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	SEC62	P21825	274 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	YCR015C	P25616	317 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	YIM1	P28625	365 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	OCT1	P35999	772 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	MTW1	P39731	289 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	TMN3	P40071	706 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	IMO32	P53219	342 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	YGR079W	P53249	370 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	GET4	Q12125	312 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	VAM3	Q12241	283 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	FMP16	Q12497	93 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	GSC2	P40989	1895 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	IMG1	P25626	169 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	ACP1	P32463	125 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	ATM1	P40416	690 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	YIR042C	P40586	236 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	PTR3	P43606	678 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	AIM22	P47051	409 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	YGL082W	P53155	381 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	UBP16	Q02863	499 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	CRT10	Q08226	957 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	CDC21	P06785	304 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	YPK2	P18961	677 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	HXT1	P32465	570 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	HIR2	P32480	875 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	STE14	P32584	239 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	YMR262W	P38430	313 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	ERG7	P38604	731 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	RFX1	P48743	811 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	COQ6	P53318	479 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	SSY1	Q03770	852 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	IPK1	Q06667	281 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	YFT2	Q06676	274 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	BAG7	Q12128	409 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	RRD2	Q12461	358 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	LAG2	Q92325	660 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YHC3	YJL059W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.53	□□□□□ -1.36	not detected
YHC3	YJL059W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36

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