RNA–Protein interactions for RNA: YGL009C

LEU1, Transcript of Isopropylmalate isomerase, yeast

Gene LEU1, Length 2,340 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LEU1	YGL009C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
LEU1	YGL009C	DDC1	Q08949	612 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RIM20	Q12033	661 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YOS9	Q99220	542 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	ECM3	Q99252	613 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	APC1	P53886	1748 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	AI3	P03877	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
LEU1	YGL009C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	IMG1	P25626	169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	CIN8	P27895	1000 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	ATP11	P32453	318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YKL063C	P35725	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	CAF4	P36130	643 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	MAL32	P38158	584 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	CST26	P38226	397 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	GTS1	P40956	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	COS12	P53053	380 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YGR111W	P53265	400 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	MAL12	P53341	584 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
LEU1	YGL009C	FYV6	P53913	173 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	THI7	Q05998	598 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	ATG31	Q12421	196 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SPE4	Q12455	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	CMK2	P22517	447 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	BEM1	P29366	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	ATP7	P30902	174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	DCG1	P32460	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RRT2	P38332	387 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	VMA22	P38784	181 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	PTC7	P38797	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	AFG3	P39925	761 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YER121W	P40076	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	TOS3	P43637	560 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	OKP1	P53298	406 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	TAF12	Q03761	539 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	CDD1	Q06549	142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YEH1	Q07804	573 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RDR1	Q08904	546 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
LEU1	YGL009C	VPS33	P20795	691 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	KRE2	P27809	442 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	VID24	P38263	362 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	FHL1	P39521	936 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YER184C	P39961	794 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	JHD1	P40034	492 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	GET2	P40056	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	IRC7	P43623	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	ARR3	Q06598	404 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	TPO1	Q07824	586 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	BSC6	Q08280	497 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	BUD7	Q08754	746 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YDR262W	Q12331	272 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SWM1	Q12379	170 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	MSF1	P08425	469 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	UGA1	P17649	471 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	SSO1	P32867	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	CYM1	P32898	989 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	REG2	P38232	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	MLH1	P38920	769 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	CCT6	P39079	546 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	SER3	P40054	469 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	ATM1	P40416	690 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	YGR066C	P53242	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	MRP51	Q02950	344 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	KRE28	Q04431	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	AIM33	Q04516	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	THI22	Q06490	572 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	SEC12	P11655	471 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	NDI1	P32340	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LEU1	YGL009C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.6 ms