RNA–Protein interactions for RNA: YDR057W

YOS9, Transcript of ER quality-control lectin, yeast

Gene YOS9, Length 1,629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOS9	YDR057W	RFC5	P38251	354 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	RCK2	P38623	610 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	STB5	P38699	743 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YEL057C	P39983	233 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	GIP2	P40036	548 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	VRG4	P40107	337 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	SHR5	P41912	237 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YJL181W	P46987	611 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YJR149W	P47177	404 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YIP3	P53633	176 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	MFM1	Q02783	413 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	NHP10	Q03435	203 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	PPM1	Q04081	328 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	CSM3	Q04659	317 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	CDC123	Q05791	360 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	ECM30	Q06673	1274 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	SYT1	Q06836	1226 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	FRE5	Q08908	694 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.55	□□□□□ -1.36	not detected
YOS9	YDR057W	SUL2	Q12325	893 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	PPA2	P28239	310 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	TGL1	P34163	548 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	SEF1	P34228	1148 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	PSF2	P40359	213 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YGR201C	P42936	225 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	IRC5	P43610	853 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	NMD5	P46970	1048 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YJL163C	P46996	555 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	GPI1	P53306	609 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	ADY4	Q05955	493 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	NRT1	Q08485	598 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	PRC1	P00729	532 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	CNA1	P23287	553 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	SPR1	P32603	445 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	ISC10	P32645	267 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YBR197C	P38306	217 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	RMD6	P39975	231 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	SLZ1	P40167	298 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	HIT1	P46973	164 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	ARL3	Q02804	198 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YPL080C	Q02826	108 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	NEJ1	Q06148	342 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YAP7	Q08182	245 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YPK9	Q12697	1472 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	NFS1	P25374	497 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	TUL1	P36096	758 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YCR087C-A	P37263	153 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	LDH1	P38139	375 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	THI2	P38141	450 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	ECM8	P38246	354 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YBR259W	P38338	688 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	BDH1	P39714	382 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	POG1	P40473	351 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	FAR7	P43592	221 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YAR1	P46683	200 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	BNA2	P47125	453 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	NAS6	P50086	228 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	DAM1	P53267	343 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	SOV1	Q04748	898 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	COA4	Q05809	96 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	DCI1	Q08558	271 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	GPM2	Q12008	311 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	CBP1	P07252	654 aa		6.52	□□□□□ -1.37
YOS9	YDR057W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
YOS9	YDR057W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
YOS9	YDR057W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
YOS9	YDR057W	BET2	P20133	325 aa		6.52	□□□□□ -1.37

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