RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 ELF1P32519 619 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 EHHADHQ08426 723 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 KCNMA1Q12791 1236 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 SEMA3FQ13275 785 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 TSKSQ9UJT2 592 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 GGA2Q9UJY4 613 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 NFS1Q9Y697 457 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 CASZ1Q86V15 1759 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 MYBP10242 640 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 CCDC121Q6ZUS5 278 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 CCDC114Q96M63 670 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 CUEDC2Q9H467 287 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 RNF14Q9UBS8 474 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 ORC4O43929 436 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.21e-6■■■□□ 16.5
PMS1-222ENST00000639501 WLSQ5T9L3 541 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 MEI1Q5TIA1 1274 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 FAM212AQ96EL1 285 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 AFF2P51816 1311 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 OPLAHO14841 1288 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 CLSTN1O94985 981 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 ZNF844Q08AG5 666 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 RPAINQ86UA6 219 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 FUKQ8N0W3 1084 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 MTMR7Q9Y216 660 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 GMNCA6NCL1 334 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 TRAPPC3O43617 180 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 CYTH3O43739 400 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.56■■□□□ 1.2
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PMS1-222ENST00000639501 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 ITGB4P16144 1822 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 A0A0G2JS52 829 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 TSPY2A6NKD2 308 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 OR52Z1P0C646 297 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 PRPHP41219 470 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 TECP42680 631 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 NAB2Q15742 525 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 PTPROQ16827 1216 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 CEP57Q86XR8 500 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 PARP9Q8IXQ6 854 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 GRID2IPA4D2P6 1211 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 MYMKA6NI61 221 aa22.55■■□□□ 1.2
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PMS1-222ENST00000639501 NOL4O94818 638 aa22.55■■□□□ 1.2
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PMS1-222ENST00000639501 KIF5BP33176 963 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 FLT3P36888 993 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 LETM2Q2VYF4 491 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 DYMQ7RTS9 669 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.55■■□□□ 1.2
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PMS1-222ENST00000639501 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 LAMB1P07942 1786 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 STXBP3O00186 592 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 ATP2C2O75185 946 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 DRP2Q13474 957 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 TMEM59LQ9UK28 342 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA6L10A6NI86 522 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 LRRC41Q15345 812 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 SNCBQ16143 134 aa22.54■■□□□ 1.2
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