RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637648.1

RNASEH2B-211, Transcript of ribonuclease H2 subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene RNASEH2B, Length 547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH2B-211ENST00000637648 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
RNASEH2B-211ENST00000637648 TELO2Q9Y4R8 837 aa25.08■■□□□ 1.61
RNASEH2B-211ENST00000637648 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.08■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 TGFB3P10600 412 aa25.07■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 RTN1Q16799 776 aa25.07■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 TYW1BQ6NUM6 668 aa25.07■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa25.07■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 SPATA33Q96N06 139 aa25.07■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 ALG1Q9BT22 464 aa25.07■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 SEMA6BQ9H3T3 888 aa25.07■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa25.06■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 FGBP02675 491 aa25.06■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 PSEN2P49810 448 aa25.06■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 APOBRQ0VD83 1088 aa25.06■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 WWC2Q6AWC2 1192 aa25.06■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 Q6ZUG5 572 aa25.06■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 HDAC6Q9UBN7 1215 aa25.06■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 V9GY48 417 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 GOLGA8AA7E2F4 631 aa25.05■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 GOLGA8BA8MQT2 603 aa25.05■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 HAS3O00219 553 aa25.05■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 ICAM3P32942 547 aa25.05■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 ADD1P35611 737 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 PTGISQ16647 500 aa25.05■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 ZNF697Q5TEC3 545 aa25.05■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.05■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 OTOP2Q7RTS6 562 aa25.05■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 MLXIPQ9HAP2 919 aa25.05■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 PPFIA4O75335 1185 aa25.04■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 F2P00734 622 aa25.04■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 HIC1Q14526 733 aa25.04■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 MFSD10Q14728 455 aa25.04■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 KIAA0753Q2KHM9 967 aa25.04■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 SESTD1Q86VW0 696 aa25.04■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 HERVK_113Q902F9 699 aa25.04■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 BRF1Q92994 677 aa25.04■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 C16orf70Q9BSU1 422 aa25.04■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 CDH23Q9H251 3354 aa25.04■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 STAM2O75886 525 aa25.03■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 PBX2P40425 430 aa25.03■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 GNPTABQ3T906 1256 aa25.03■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.03■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 CYFIP1Q7L576 1253 aa25.03■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 DEFB128Q7Z7B8 93 aa25.03■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.03■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa25.03■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 PCDHA6Q9UN73 950 aa25.03■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa25.03■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.03■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 SCN5AQ14524 2016 aa25.02■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 FIBPO43427 364 aa25.02■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 REC8O95072 547 aa25.02■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 IQCF3P0C7M6 154 aa25.02■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 RPS6KB1P23443 525 aa25.02■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 FGD1P98174 961 aa25.02■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 C7orf31Q8N865 590 aa25.02■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 NOD1Q9Y239 953 aa25.02■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 DOCK5Q9H7D0 1870 aa25.02■■□□□ 1.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 ATP9AO75110 1047 aa25.01■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 ITGB5P18084 799 aa25.01■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 DNAJB2P25686 324 aa25.01■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 STXBP3O00186 592 aa25■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 NAPAP54920 295 aa25■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 GPNMBQ14956 572 aa25■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 XRRA1Q6P2D8 792 aa25■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 WNT8BQ93098 351 aa25■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 PGBD1Q96JS3 809 aa25■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 USP26Q9BXU7 913 aa25■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 PBX4Q9BYU1 374 aa25■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 PITPNM1O00562 1244 aa24.99■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 NEDD9Q14511 834 aa24.99■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 METTL7BQ6UX53 244 aa24.99■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 RETREG2Q8NC44 543 aa24.99■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 GPR20Q99678 358 aa24.99■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 KATNAL1Q9BW62 490 aa24.99■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.99■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.98■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 ADAMTS3O15072 1205 aa24.98■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 PPFIA3O75145 1194 aa24.98■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 LGALS2P05162 132 aa24.98■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 RCAN1P53805 252 aa24.98■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 SP4Q02446 784 aa24.98■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 BFSP2Q13515 415 aa24.98■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 NLRX1Q86UT6 975 aa24.98■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 FBXL16Q8N461 479 aa24.98■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 RIC8AQ9NPQ8 531 aa24.98■■□□□ 1.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 TMEM260Q9NX78 707 aa24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms