RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627487.2

PCBP1-AS1-315, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 668 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SNHG28P0DPA3 235 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SLC1A4P43007 532 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 KLRC3Q07444 240 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 USP17L24Q0WX57 530 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MTA1Q13330 715 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SLFN13Q68D06 897 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 Q6ZUG5 572 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CYB5R4Q7L1T6 521 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MB21D1Q8N884 522 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 RUBCNLQ9H714 662 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 LY9Q9HBG7 655 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 FEM1BQ9UK73 627 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 DOCK3Q8IZD9 2030 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PARP14Q460N5 1801 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 A0A1B0GTH6 734 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 TRIM75PA6NK02 468 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CDKL5O76039 1030 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 BMP3P12645 472 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 COPB2P35606 906 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 OAZ1P54368 228 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ANTXR2P58335 489 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ATP2B2Q01814 1243 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 TROAPQ12815 778 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 COG2Q14746 738 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 C4orf17Q53FE4 359 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 LBX2Q6XYB7 198 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MOB2Q70IA6 237 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 FANCBQ8NB91 859 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SNX21Q969T3 373 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CLMNQ96JQ2 1002 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CAPNS2Q96L46 248 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 INCENPQ9NQS7 918 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 NID2Q14112 1375 aa6.51□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 A0A1W2PRG0 241 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SMIM22K7EJ46 135 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 NDUFB10O96000 172 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PDHBP11177 359 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MSX1P28360 303 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MAP2K3P46734 347 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 STAT2P52630 851 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 HMGCS2P54868 508 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 JAG1P78504 1218 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ZNF543Q08ER8 600 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 BECN1Q14457 450 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 GRM4Q14833 912 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ARHGEF6Q15052 776 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CCL15Q16663 113 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 GNASQ5JWF2 1037 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 APOA5Q6Q788 366 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 DLK2Q6UY11 383 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ACER1Q8TDN7 264 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 WASF1Q92558 559 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 BRF1Q92994 677 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 KIF2CQ99661 725 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 GLT8D2Q9H1C3 349 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms