RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621870.4

GGA3-223, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 1 (best)

Gene GGA3, Length 4,034 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-223	ENST00000621870	ACAD9	Q9H845	621 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	COG2	Q14746	738 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	TICAM2	Q86XR7	235 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	ABCB11	O95342	1321 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	LMNB1	P20700	586 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	DDIT3	P35638	169 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	PIK3CA	P42336	1068 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	ARPP19	P56211	112 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	OXER1	Q8TDS5	423 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	FAM151A	Q8WW52	585 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	LRRN2	O75325	713 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	NT5C1B	Q96P26	610 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	ACCS	Q96QU6	501 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	DESI2	Q9BSY9	194 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	NDC80	O14777	642 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	GAP43	P17677	238 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	WDR64	B1ANS9	1081 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	ORC4	O43929	436 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	ENTPD3	O75355	529 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	GAS8	O95995	478 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	TUBB4A	P04350	444 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	HOXD10	P28358	340 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	REST	Q13127	1097 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	RPS6KA1	Q15418	735 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	PTPN21	Q16825	1174 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	DAAM2	Q86T65	1068 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	GPT2	Q8TD30	523 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	POLL	Q9UGP5	575 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	MEGF6	O75095	1541 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	SRGN	P10124	158 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	BANK1	Q8NDB2	785 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	ABCC12	Q96J65	1359 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	PTK2	Q05397	1052 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	CCDC14	Q49A88	953 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	RAET1E	Q8TD07	263 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	P2RX5	Q93086	422 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	TTLL4	Q14679	1199 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	GRM4	Q14833	912 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	C8orf74	Q6P047	294 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	H2AFV	Q71UI9	128 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	MMP19	Q99542	508 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	DCC	P43146	1447 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	PDE6C	P51160	858 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	DYNC1I1	O14576	645 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	TDP2	O95551	362 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	CYP2B6	P20813	491 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-223	ENST00000621870	CASP1	P29466	404 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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