RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621269.4

ATXN3-253, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 936 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-253	ENST00000621269	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
ATXN3-253	ENST00000621269	LIFR	P42702	1097 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ATXN3-253	ENST00000621269	SP2	Q02086	613 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ATXN3-253	ENST00000621269	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ATXN3-253	ENST00000621269	RNF20	Q5VTR2	975 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ATXN3-253	ENST00000621269	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ATXN3-253	ENST00000621269	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ATXN3-253	ENST00000621269	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ATXN3-253	ENST00000621269	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	RABGGTB	P53611	331 aa		27.7	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		27.7	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		27.7	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		27.7	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	SKAP1	Q86WV1	359 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	HAS3	O00219	553 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	RXRA	P19793	462 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	27.68	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	SELP	P16109	830 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269		A0A0C4DFX4	3053 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	CDH23	Q9H251	3354 aa		27.66	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	PIK3CD	O00329	1044 aa		27.66	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	PTK7	Q13308	1070 aa		27.66	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	NEDD9	Q14511	834 aa		27.66	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		27.66	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		27.66	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		27.66	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	FANCB	Q8NB91	859 aa		27.66	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	SLC9A7	Q96T83	725 aa		27.66	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	EYS	Q5T1H1	3165 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	MEIS2	O14770	477 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	FIBP	O43427	364 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	MYOG	P15173	224 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	ICAM3	P32942	547 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	NEK1	Q96PY6	1258 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	BAIAP3	O94812	1187 aa		27.64	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	CKB	P12277	381 aa		27.64	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	RBL2	Q08999	1139 aa		27.64	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		27.64	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		27.64	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		27.64	■■■□□ 2.02
ATXN3-253	ENST00000621269	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		27.64	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	MICU3	Q86XE3	530 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	SCN5A	Q14524	2016 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269		H3BRB1	525 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	CDC45	O75419	566 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	IGFBP4	P22692	258 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	KCNJ6	P48051	423 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	METTL7B	Q6UX53	244 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	NLRX1	Q86UT6	975 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	KIF28P	B7ZC32	967 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	LGALS2	P05162	132 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	PPM1E	Q8WY54	764 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	USP26	Q9BXU7	913 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	GBF1	Q92538	1859 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	CA3	P07451	260 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	SEMA3F	Q13275	785 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	KRT32	Q14532	448 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	GPNMB	Q14956	572 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	USP38	Q8NB14	1042 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
ATXN3-253	ENST00000621269	GPR20	Q99678	358 aa		27.59	■■■□□ 2.01

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