RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620074.4

UBXN8-209, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-209ENST00000620074 NAPAP54920 295 aa12.7□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 EVCP57679 992 aa12.7□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 PSMC6P62333 389 aa12.7□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 LAMC2Q13753 1193 aa12.7□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 PCNX4Q63HM2 1172 aa12.7□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 WWC2Q6AWC2 1192 aa12.7□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 AFG1LQ8WV93 481 aa12.7□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 BADQ92934 168 aa12.7□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 GLT8D2Q9H1C3 349 aa12.7□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 EHMT1Q9H9B1 1298 aa12.7□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 V9GY48 417 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 SPDYE3A6NKU9 549 aa12.69□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 STXBP3O00186 592 aa12.69□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 ICAM3P32942 547 aa12.69□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 ADD1P35611 737 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 ANAPC15P60006 121 aa12.69□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 DGKDQ16760 1214 aa12.69□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 LRIT3Q3SXY7 679 aa12.69□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 PPTC7Q8NI37 304 aa12.69□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 RIC8AQ9NPQ8 531 aa12.69□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 BARHL2Q9NY43 387 aa12.69□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 MYH7BA7E2Y1 1941 aa12.68□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 FIBPO43427 364 aa12.68□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 GGPS1O95749 300 aa12.68□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 TIMP1P01033 207 aa12.68□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 SCG2P13521 617 aa12.68□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 ITGB8P26012 769 aa12.68□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 ADCY7P51828 1080 aa12.68□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 FPGSQ05932 587 aa12.68□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 UBE2SQ16763 222 aa12.68□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 MYSM1Q5VVJ2 828 aa12.68□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 NFRKBQ6P4R8 1299 aa12.68□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 NLRX1Q86UT6 975 aa12.68□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 B4GALT4O60513 344 aa12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 FOSP01100 380 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 IFNAR1P17181 557 aa12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 NEDD9Q14511 834 aa12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 NBPF20Q3BBV1 942 aa12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 MFSD5Q6N075 450 aa12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 TYW1BQ6NUM6 668 aa12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 GPRASP2Q96D09 838 aa12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 CDHR1Q96JP9 859 aa12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 SPATA33Q96N06 139 aa12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 KATNAL1Q9BW62 490 aa12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 MLXIPQ9HAP2 919 aa12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 PDRG1Q9NUG6 133 aa12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 PCDHA6Q9UN73 950 aa12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa12.67□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 ESYT2A0FGR8 921 aa12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 SMCO2A6NFE2 343 aa12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 PPFIA4O75335 1185 aa12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 F2P00734 622 aa12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 SP2Q02086 613 aa12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 SEMA3FQ13275 785 aa12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 AP3B2Q13367 1082 aa12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 NTRK3Q16288 839 aa12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 HSDL1Q3SXM5 330 aa12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 FAM47CQ5HY64 1035 aa12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 SESTD1Q86VW0 696 aa12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM199Q8N511 208 aa12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 IL17RAQ96F46 866 aa12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 SENP7Q9BQF6 1050 aa12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 TRPV6Q9H1D0 765 aa12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 HIPK3Q9H422 1215 aa12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 RTEL1Q9NZ71 1219 aa12.66□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 CLK2P49760 499 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 PSEN2P49810 448 aa12.65□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 CCT2P78371 535 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 MCTP2Q6DN12 878 aa12.65□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 GPR153Q6NV75 609 aa12.65□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 METTL7BQ6UX53 244 aa12.65□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 CCDC148Q8NFR7 591 aa12.65□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 KAT2BQ92831 832 aa12.65□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 PHKBQ93100 1093 aa12.65□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
UBXN8-209ENST00000620074 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms