RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619348.4

CYFIP1-211, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CYFIP1, Length 3,471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-211ENST00000619348 SEC23AQ15436 765 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 TSKSQ9UJT2 592 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 RHOBTB3O94955 611 aa14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 MEA1Q16626 185 aa14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 NAALADL2Q58DX5 795 aa14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 SMTNP53814 917 aa14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 QPCTQ16769 361 aa14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 CCDC38Q502W7 563 aa14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 VPS36Q86VN1 386 aa14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 CCDC197Q8NCU1 140 aa14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 PNMA2Q9UL42 364 aa14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 PPP2R2AP63151 447 aa14.52□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.52□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 MEGF6O75095 1541 aa14.52□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 A0A087X0T9 212 aa14.52□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 DDAH1O94760 285 aa14.52□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 FSBPO95073 299 aa14.52□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 FAM228BP0C875 321 aa14.52□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 SKOR1P84550 965 aa14.52□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 LRRC14Q15048 493 aa14.52□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.52□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.52□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 TBCKQ8TEA7 893 aa14.52□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 SGSM3Q96HU1 749 aa14.52□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 SEMA6BQ9H3T3 888 aa14.52□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 C6orf50Q9HD87 102 aa14.52□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 KLRF2D3W0D1 207 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 TTI1O43156 1089 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 MYBL1P10243 752 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 CALCRLQ16602 461 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 SPDL1Q96EA4 605 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 RAB34Q9BZG1 259 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 RICTORQ6R327 1708 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 IQCKQ8N0W5 287 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 RAPGEF5Q92565 580 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 TRIM51Q9BSJ1 452 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 ENO4A6NNW6 628 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 MMEP08473 750 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 ACTN1P12814 892 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 FECHP22830 423 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 FUKQ8N0W3 1084 aa14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 SLC8A1P32418 973 aa14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 SCTRP47872 440 aa14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 ERVK-9P63128 1117 aa14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 KCNB1Q14721 858 aa14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 KIF2BQ8N4N8 673 aa14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 ACSBG1Q96GR2 724 aa14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 NLRP3Q96P20 1036 aa14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 DNM1LO00429 736 aa14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 PDXDC1Q6P996 788 aa14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 PIGBQ92521 554 aa14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 CAVIN3Q969G5 261 aa14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 TMEM260Q9NX78 707 aa14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 MST1RQ04912 1400 aa14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 ITGA4P13612 1032 aa14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 SARNPP82979 210 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 MIIPQ5JXC2 388 aa14.5□□□□□ -0.09
CYFIP1-211ENST00000619348 SUSD4Q5VX71 490 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms