RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 XRRA1Q6P2D8 792 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PXYLP1Q8TE99 480 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KATNBL1Q9H079 304 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FIBPO43427 364 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARIH2O95376 493 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SETQ01105 290 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SEMA3FQ13275 785 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LY6KQ17RY6 165 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 COPS5Q92905 334 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 JADE2Q9NQC1 790 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CLIC4Q9Y696 253 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STAM2O75886 525 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TXNP10599 105 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRAPPC10P48553 1259 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CALCRLQ16602 461 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TPRNQ4KMQ1 711 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TAPT1Q6NXT6 567 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SCFD2Q8WU76 684 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPRASP2Q96D09 838 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP28Q96RU2 1077 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF577Q9BSK1 485 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MCOLN1Q9GZU1 580 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCNH7Q9NS40 1196 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MSH4O15457 936 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADCY6O43306 1168 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CHMP2AO43633 222 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CIITAP33076 1130 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TNFAIP2Q03169 654 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TTLL4Q14679 1199 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MTFR1Q15390 333 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LENG9Q96B70 501 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UNC93B1Q9H1C4 597 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM60Q9H2L4 133 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM184BQ9ULE4 1060 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TCHHQ07283 1943 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa16.46■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MEIS1O00470 390 aa16.46■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ATP9AO75110 1047 aa16.46■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GGPS1O95749 300 aa16.46■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AKR1A1P14550 325 aa16.46■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMPD1P17405 629 aa16.46■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 Q4G0T1 1027 aa16.46■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPP4R3AQ6IN85 833 aa16.46■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MOXD1Q6UVY6 613 aa16.46■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR6J1Q8NGC5 347 aa16.46■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CDHR1Q96JP9 859 aa16.46■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SDF4Q9BRK5 362 aa16.46■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BCAS3Q9H6U6 928 aa16.46■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa16.46■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BAG4O95429 457 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGHA2P01877 340 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR52Z1P0C646 297 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CYP3A7P24462 503 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TXKP42681 527 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SP2Q02086 613 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PTGDRQ13258 359 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STK38Q15208 465 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LRCH2Q5VUJ6 765 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CYFIP1Q7L576 1253 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NIPA1Q7RTP0 329 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TLK2Q86UE8 772 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MBOAT7Q96N66 472 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MLXIPQ9HAP2 919 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SEPT4O43236 478 aa16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GAS7O60861 476 aa16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCL5P13501 91 aa16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCNA2P16389 499 aa16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ICAM3P32942 547 aa16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NCAPH2Q6IBW4 605 aa16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ETNPPLQ8TBG4 499 aa16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TEKT3Q9BXF9 490 aa16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RNF208Q9H0X6 261 aa16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GDPD2Q9HCC8 539 aa16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms