RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606577.1

SNORD96A-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 96A, humanhuman

BASIC

Gene SNORD96A, Length 79 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Exosome, Nucleolus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD96A-201ENST00000606577 FERMT3Q86UX7 667 aa7.56□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 SAMD3Q8N6K7 520 aa7.56□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 OR6J1Q8NGC5 347 aa7.56□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 CRYGNQ8WXF5 182 aa7.56□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 FERMT2Q96AC1 680 aa7.56□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa7.56□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.56□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 LTBP2Q14767 1821 aa7.56□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 FOSP01100 380 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 XBP1P17861 261 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 ZNF76P36508 570 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 CHMP4BP1P59074 171 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 ARHGAP1Q07960 439 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 MTMR1Q13613 665 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 PKP1Q13835 747 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 LETM2Q2VYF4 491 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 DUSP28Q4G0W2 176 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 PRR16Q569H4 304 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 MCTP1Q6DN14 999 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 KRT25Q7Z3Z0 450 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 PLA2G4DQ86XP0 818 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 BICD2Q8TD16 824 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 SCFD2Q8WU76 684 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 AFG1LQ8WV93 481 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 LENG9Q96B70 501 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 MXRA8Q9BRK3 442 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 NRBP1Q9UHY1 535 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 OGDHLQ9ULD0 1010 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 TANC1Q9C0D5 1861 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 B4DLN1 442 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 H3BQV1 296 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 MYL3P08590 195 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 CYP3A4P08684 503 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 ZNF286BP0CG31 522 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 KCNA2P16389 499 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 SYT1P21579 422 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 GJA9P57773 515 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 PSMC6P62333 389 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 TTLL4Q14679 1199 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 KCNA10Q16322 511 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 HSDL1Q3SXM5 330 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 CEP55Q53EZ4 464 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 IFFO2Q5TF58 517 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 IQSEC1Q6DN90 963 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 FAM173BQ6P4H8 233 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 NLRX1Q86UT6 975 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 TRIM50Q86XT4 487 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 POTEDQ86YR6 584 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 MAF1Q9H063 256 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 GLT8D2Q9H1C3 349 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 JADE2Q9NQC1 790 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 KCNH7Q9NS40 1196 aa7.54□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 A0A1W2PQY0 241 aa7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 KBTBD13C9JR72 458 aa7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 MEIS1O00470 390 aa7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 MSH4O15457 936 aa7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 FIBPO43427 364 aa7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 CHMP2AO43633 222 aa7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 CCNE2O96020 404 aa7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 GH1P01241 217 aa7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 ASGR1P07306 291 aa7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 MMP3P08254 477 aa7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 ICAM3P32942 547 aa7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 ACLYP53396 1101 aa7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 ZNF174Q15697 407 aa7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 GNPTABQ3T906 1256 aa7.53□□□□□ -1.2
SNORD96A-201ENST00000606577 GNASQ5JWF2 1037 aa7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms