RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590096.1

ATG4D-212, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 1,282 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-212ENST00000590096 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 BRMS1Q9HCU9 246 aa24.31■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 PHF24Q9UPV7 400 aa24.31■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 ICAM3P32942 547 aa24.3■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 FOSBP53539 338 aa24.3■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 ARHGAP4P98171 946 aa24.3■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 GJB4Q9NTQ9 266 aa24.3■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa24.3■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.29■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 CTAGE5O15320 804 aa24.29■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 NPY5RQ15761 445 aa24.29■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 FERMT2Q96AC1 680 aa24.29■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 MYH7BA7E2Y1 1941 aa24.28■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 ASGR1P07306 291 aa24.28■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 CYP3A4P08684 503 aa24.28■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 ITGB5P18084 799 aa24.28■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 ACLYP53396 1101 aa24.28■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 ARHGAP1Q07960 439 aa24.28■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 MTMR1Q13613 665 aa24.28■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 LAMC2Q13753 1193 aa24.28■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 NEDD9Q14511 834 aa24.28■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 KRT25Q7Z3Z0 450 aa24.28■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 MXRA8Q9BRK3 442 aa24.28■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 JADE2Q9NQC1 790 aa24.28■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 KIF3AQ9Y496 699 aa24.28■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 A0A1W2PQY0 241 aa24.27■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 M0R2N6 131 aa24.27■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 MAFGO15525 162 aa24.27■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 GGPS1O95749 300 aa24.27■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 KRT2P35908 639 aa24.27■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 CEP55Q53EZ4 464 aa24.27■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 KRT40Q6A162 431 aa24.27■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 C8orf76Q96K31 380 aa24.27■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 MLXIPQ9HAP2 919 aa24.27■■□□□ 1.48
ATG4D-212ENST00000590096 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.26■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 MMP1P03956 469 aa24.26■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 SP2Q02086 613 aa24.26■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 SEMA3FQ13275 785 aa24.26■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 CRYGNQ8WXF5 182 aa24.26■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 VTI1AQ96AJ9 217 aa24.26■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 GLT1D1Q96MS3 346 aa24.26■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 SENP7Q9BQF6 1050 aa24.26■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 STARD7Q9NQZ5 370 aa24.26■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 POLR3EQ9NVU0 708 aa24.26■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 A6NJR5 290 aa24.25■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 SORBS3O60504 671 aa24.25■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 CABYRO75952 493 aa24.25■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 MYL3P08590 195 aa24.25■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.25■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.25■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 TBCKQ8TEA7 893 aa24.25■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 AFG1LQ8WV93 481 aa24.25■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 USP11P51784 963 aa24.24■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.24■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 CYFIP1Q7L576 1253 aa24.24■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 NIPA1Q7RTP0 329 aa24.24■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 PPTC7Q8NI37 304 aa24.24■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 CYP2W1Q8TAV3 490 aa24.24■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 OXER1Q8TDS5 423 aa24.24■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 DPF3Q92784 378 aa24.24■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 SPATA33Q96N06 139 aa24.24■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 KCNH7Q9NS40 1196 aa24.24■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 PKD2L1Q9P0L9 805 aa24.24■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 FAM86B1E9PN63 330 aa24.23■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 MEIS1O00470 390 aa24.23■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 KPNA6O60684 536 aa24.23■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 MMP3P08254 477 aa24.23■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 FAM86B2P0C5J1 330 aa24.23■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 SETQ01105 290 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 GUCY1B3Q02153 619 aa24.23■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 METTL7BQ6UX53 244 aa24.23■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa24.23■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 PLA2G4DQ86XP0 818 aa24.23■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.23■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 ELP1O95163 1332 aa24.23■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 NOP56O00567 594 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 KCNA2P16389 499 aa24.22■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 GJB2P29033 226 aa24.22■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 CIITAP33076 1130 aa24.22■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 DGKDQ16760 1214 aa24.22■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa24.22■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 DOCK5Q9H7D0 1870 aa24.21■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 ATP9AO75110 1047 aa24.21■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 ARP10275 920 aa24.21■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 NR5A1Q13285 461 aa24.21■■□□□ 1.47
ATG4D-212ENST00000590096 INF2Q27J81 1249 aa24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms