RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589239.5

RFX1-205, Transcript of regulatory factor X1, human

TSL 2

Gene RFX1, Length 2,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RFX1-205	ENST00000589239	TBX3	O15119	743 aa		27.95	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	RGS20	O76081	388 aa		27.95	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	LIG1	P18858	919 aa		27.95	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	RESP18	Q5W5W9	173 aa		27.95	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		27.95	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	EPSTI1	Q96J88	318 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	MBD3	O95983	291 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	CDC25A	P30304	524 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	PDE4D	Q08499	809 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	MORN1	Q5T089	497 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	FAM20A	Q96MK3	541 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	PP2D1	A8MPX8	630 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	27.92	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	POTEM	A6NI47	508 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	STAM2	O75886	525 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	PFKFB1	P16118	471 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	NDUFA8	P51970	172 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	NLRX1	Q86UT6	975 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	SLC5A5	Q92911	643 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239		B4DLN1	442 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	NR1I2	O75469	434 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	PSMC4	P43686	418 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	GPRASP2	Q96D09	838 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	SP3	Q02447	781 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	MAP2K5	Q13163	448 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	SEMA3F	Q13275	785 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	MAML3	Q96JK9	1138 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	ATP9A	O75110	1047 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	TRIM47	Q96LD4	638 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	HPSE	Q9Y251	543 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RFX1-205	ENST00000589239	ASB14	A6NK59	587 aa		27.89	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	FCGRT	P55899	365 aa		27.89	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	ARMCX2	Q7L311	632 aa		27.89	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	MORC4	Q8TE76	937 aa		27.89	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	AK8	Q96MA6	479 aa		27.89	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	RAB34	Q9BZG1	259 aa		27.89	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	DACT1	Q9NYF0	836 aa		27.89	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		27.89	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		27.89	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	GJD2	Q9UKL4	321 aa		27.89	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	VAV3	Q9UKW4	847 aa		27.89	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	PSMD10	O75832	226 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	PDIA5	Q14554	519 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	GAS7	O60861	476 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	CAP1	Q01518	475 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	USP6NL	Q92738	828 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	MAFG	O15525	162 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	ESPN	B1AK53	854 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	CYP2B6	P20813	491 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RFX1-205	ENST00000589239	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05

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