RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NDST4Q9H3R1 872 aa18.34■□□□□ 0.53
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIAA1024Q9UPX6 916 aa18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SIK3Q9Y2K2 1263 aa18.34■□□□□ 0.53
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 STAT3P40763 770 aa18.29■□□□□ 0.52
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CATSPER3Q86XQ3 398 aa18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PARD6BQ9BYG5 372 aa18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EDEM3Q9BZQ6 932 aa18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM10Q9UDY6 481 aa18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MARSP56192 900 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRAF1Q13077 416 aa18.28■□□□□ 0.52
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