RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585084.5

GPS1-225, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-225	ENST00000585084	SCN5A	Q14524	2016 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	F2	P00734	622 aa		32.89	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	CALM1	P0DP23	149 aa		32.89	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	CALM2	P0DP24	149 aa		32.89	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	CALM3	P0DP25	149 aa		32.89	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		32.89	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		32.89	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		32.89	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		32.89	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084		A0A0C4DFX4	3053 aa		32.89	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	MYO9B	Q13459	2157 aa		32.88	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	STAM2	O75886	525 aa		32.88	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	LIFR	P42702	1097 aa		32.88	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	RABGGTB	P53611	331 aa		32.88	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	SP2	Q02086	613 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	RNF20	Q5VTR2	975 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	GBF1	Q92538	1859 aa		32.86	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	HAS3	O00219	553 aa		32.86	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		32.86	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	32.86	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		32.86	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		32.85	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	SELP	P16109	830 aa		32.85	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	RXRA	P19793	462 aa		32.85	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		32.84	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		32.84	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	SKAP1	Q86WV1	359 aa		32.84	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	SLC9A7	Q96T83	725 aa		32.84	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		32.84	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		32.83	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		32.83	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		32.83	■■■□□ 2.85
GPS1-225	ENST00000585084	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		32.82	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	PIK3CD	O00329	1044 aa		32.82	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	MYOG	P15173	224 aa		32.82	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	ICAM3	P32942	547 aa		32.82	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	PTK7	Q13308	1070 aa		32.82	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	NEDD9	Q14511	834 aa		32.82	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		32.82	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		32.82	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	FIBP	O43427	364 aa		32.81	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	BAIAP3	O94812	1187 aa		32.81	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	RBL2	Q08999	1139 aa		32.81	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		32.81	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		32.81	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	FANCB	Q8NB91	859 aa		32.81	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		32.81	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		32.8	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	MEIS2	O14770	477 aa		32.8	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	CKB	P12277	381 aa		32.8	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		32.8	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		32.8	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	IGFBP4	P22692	258 aa		32.79	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	METTL7B	Q6UX53	244 aa		32.79	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		32.79	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	MICU3	Q86XE3	530 aa		32.79	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		32.79	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	TET1	Q8NFU7	2136 aa		32.79	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	NEK1	Q96PY6	1258 aa		32.79	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	KIF28P	B7ZC32	967 aa		32.78	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084		H3BRB1	525 aa		32.78	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	KCNJ6	P48051	423 aa		32.78	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		32.78	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	NLRX1	Q86UT6	975 aa		32.78	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	PPM1E	Q8WY54	764 aa		32.78	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		32.78	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	EYS	Q5T1H1	3165 aa		32.78	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	LGALS2	P05162	132 aa		32.77	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		32.77	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	USP38	Q8NB14	1042 aa		32.77	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	USP26	Q9BXU7	913 aa		32.77	■■■□□ 2.84
GPS1-225	ENST00000585084	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		32.76	■■■□□ 2.83
GPS1-225	ENST00000585084	CDC45	O75419	566 aa		32.76	■■■□□ 2.83
GPS1-225	ENST00000585084	SEMA3F	Q13275	785 aa		32.76	■■■□□ 2.83
GPS1-225	ENST00000585084	ADGRE1	Q14246	886 aa		32.76	■■■□□ 2.83
GPS1-225	ENST00000585084	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		32.76	■■■□□ 2.83
GPS1-225	ENST00000585084	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		32.76	■■■□□ 2.83
GPS1-225	ENST00000585084	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		32.75	■■■□□ 2.83
GPS1-225	ENST00000585084	CA3	P07451	260 aa		32.75	■■■□□ 2.83
GPS1-225	ENST00000585084	GPNMB	Q14956	572 aa		32.75	■■■□□ 2.83
GPS1-225	ENST00000585084	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		32.75	■■■□□ 2.83

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms