RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 NAPAP54920 295 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 CCL23P55773 120 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP1Q07960 439 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 APOBRQ0VD83 1088 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 DGKDQ16760 1214 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 SLC43A3Q8NBI5 491 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 IL31RAQ8NI17 732 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 BRF1Q92994 677 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 TBX21Q9UL17 535 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 GBF1Q92538 1859 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 DOCK5Q9H7D0 1870 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRM-214ENST00000583153 STAM2O75886 525 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 GGPS1O95749 300 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 ACRP10323 421 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 CYP2C9P11712 490 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRM-214ENST00000583153 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.881e-7■■□□□ 12.7
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PTPRM-214ENST00000583153 NFRKBQ6P4R8 1299 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 NLRX1Q86UT6 975 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 KCNB2Q92953 911 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 SPATA33Q96N06 139 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 ALG1Q9BT22 464 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 SMCO2A6NFE2 343 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 PIK3CDO00329 1044 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 FIBPO43427 364 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 PPFIA4O75335 1185 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRM-214ENST00000583153 CDC27P30260 824 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRM-214ENST00000583153 DEFB123Q8N688 67 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRM-214ENST00000583153 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
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PTPRM-214ENST00000583153 USP26Q9BXU7 913 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRM-214ENST00000583153 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRM-214ENST00000583153 ZNF286BP0CG31 522 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 PSEN2P49810 448 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 RCAN1P53805 252 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRM-214ENST00000583153 SP4Q02446 784 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 NEDD9Q14511 834 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 MFSD10Q14728 455 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 PTGISQ16647 500 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 HSDL1Q3SXM5 330 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 WWC2Q6AWC2 1192 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF365Q70YC5 407 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 RUFY3Q7L099 469 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRM-214ENST00000583153 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
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PTPRM-214ENST00000583153 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 PPFIA3O75145 1194 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 FOSP01100 380 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 ICAM3P32942 547 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF76P36508 570 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 ADCY7P51828 1080 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 BFSP2Q13515 415 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM240Q5SV17 173 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.53□□□□□ -0.88
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