RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 ITGB8P26012 769 aa11.33□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 AP3B2Q13367 1082 aa11.33□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 TYW1BQ6NUM6 668 aa11.33□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 CXCL17Q6UXB2 119 aa11.33□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 CCDC83Q8IWF9 413 aa11.33□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 BICD2Q8TD16 824 aa11.33□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 C6orf50Q9HD87 102 aa11.33□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 COL20A1Q9P218 1284 aa11.33□□□□□ -0.6
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GGA3-209ENST00000580646 SMCO2A6NFE2 343 aa11.32□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 FDPSP14324 419 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 RAG1P15918 1043 aa11.32□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 ADCY7P51828 1080 aa11.32□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 CUL4AQ13619 759 aa11.32□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 SLC43A3Q8NBI5 491 aa11.32□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 DAGLBQ8NCG7 672 aa11.32□□□□□ -0.6
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GGA3-209ENST00000580646 RMDN3Q96TC7 470 aa11.32□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 PXMP2Q9NR77 195 aa11.32□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 STAM2O75886 525 aa11.31□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 TXNP10599 105 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 DEKP35659 375 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
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GGA3-209ENST00000580646 OR6J1Q8NGC5 347 aa11.31□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 PHF20Q9BVI0 1012 aa11.31□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 EHMT1Q9H9B1 1298 aa11.31□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 TBX21Q9UL17 535 aa11.31□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 KIF3AQ9Y496 699 aa11.31□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 GRIN2DO15399 1336 aa11.31□□□□□ -0.6
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GGA3-209ENST00000580646 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
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GGA3-209ENST00000580646 PGM5Q15124 567 aa11.3□□□□□ -0.6
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GGA3-209ENST00000580646 PDCD2LQ9BRP1 358 aa11.3□□□□□ -0.6
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GGA3-209ENST00000580646 PCDHA4Q9UN74 947 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 PPFIA3O75145 1194 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
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GGA3-209ENST00000580646 MYL3P08590 195 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 EPHB4P54760 987 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 NLRP5P59047 1200 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 PSMC6P62333 389 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 PURAQ00577 322 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
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GGA3-209ENST00000580646 NPY5RQ15761 445 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 PCNX4Q63HM2 1172 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 MFSD5Q6N075 450 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 FCHSD1Q86WN1 690 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 HSCBQ8IWL3 235 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 FAM184AQ8NB25 1140 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 AIFM3Q96NN9 605 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 A6NJR5 290 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 KPNA6O60684 536 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 CCND2P30279 289 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 SREBF1P36956 1147 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 TRIM29Q14134 588 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 UBE2SQ16763 222 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 LY6KQ17RY6 165 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 KCNV1Q6PIU1 500 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 BLIDQ8IZY5 108 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-209ENST00000580646 CRYGNQ8WXF5 182 aa11.28□□□□□ -0.6
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