RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 GPR162Q16538 588 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 TCTN2Q96GX1 697 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 CAAP1Q9H8G2 361 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 MEIS1O00470 390 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 DYRK3O43781 588 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 PDE8AO60658 829 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 POLD1P28340 1107 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 HOXC12P31275 282 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 KCNJ6P48051 423 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 GAB4Q2WGN9 574 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 RGL3Q3MIN7 710 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC140Q96MF4 163 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 HSPA12BQ96MM6 686 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 PRAM1Q96QH2 718 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 GPATCH2Q9NW75 528 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 MAP3K5Q99683 1374 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 WASH4PA8MWX3 477 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 MARCH6O60337 910 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 APPP05067 770 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 ITIH2P19823 946 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 STAT3P40763 770 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 CLCN7P51798 805 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 AMPD2Q01433 879 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 MAP4K2Q12851 820 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 DDB1Q16531 1140 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 CDKAL1Q5VV42 579 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRM-208ENST00000578600 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRM-208ENST00000578600 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 C1orf159Q96HA4 380 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA0232Q92628 1395 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 A0A087X0B3 334 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRM-208ENST00000578600 BMP8BP34820 402 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 GABREP78334 506 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 POU4F1Q01851 419 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 NTRK3Q16288 839 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 SLC15A2Q16348 729 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 KREMEN2Q8NCW0 462 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 NETO1Q8TDF5 533 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 COPS5Q92905 334 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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PTPRM-208ENST00000578600 PIM2Q9P1W9 311 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 MAPRE3Q9UPY8 281 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 BCL9O00512 1426 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRM-208ENST00000578600 H3BS24 57 aa7.24□□□□□ -1.25
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PTPRM-208ENST00000578600 CPP00450 1065 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 FOSL1P15407 271 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 NFKB2Q00653 900 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 DPY19L1Q2PZI1 675 aa7.24□□□□□ -1.25
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PTPRM-208ENST00000578600 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 UBE2FQ969M7 185 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 CEP89Q96ST8 783 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 HOMER2Q9NSB8 354 aa7.24□□□□□ -1.25
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