RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 PXMP2Q9NR77 195 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 ZMYM6O95789 1325 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 CFBP00751 764 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 NR3C2P08235 984 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 PNMA1Q8ND90 353 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 NEK9Q8TD19 979 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 LAMA4Q16363 1823 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 EMSYQ7Z589 1322 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 DCXO43602 365 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 UPP2O95045 317 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 RSPH10BP0C881 870 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 MRE11P49959 708 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 GPM6BQ13491 265 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 FBXO11Q86XK2 927 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 BANK1Q8NDB2 785 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 ESR2Q92731 530 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 YME1L1Q96TA2 773 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 PIEZO1Q92508 2521 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.45■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.45■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 SERINC5Q86VE9 423 aa20.45■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 SPATA33Q96N06 139 aa20.45■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 KAT14Q9H8E8 782 aa20.45■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa20.45■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 GGPS1O95749 300 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 CTSHP09668 335 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 DGKHQ86XP1 1220 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 SAMD11Q96NU1 681 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 H3BNC9 293 aa20.43■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 KDM4AO75164 1064 aa20.43■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 RGS20O76081 388 aa20.43■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 PDE1AP54750 535 aa20.43■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 NHLH1Q02575 133 aa20.43■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 ZP2Q05996 745 aa20.43■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.43■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.43■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 ATP6V0A1Q93050 837 aa20.43■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 FBXL18Q96ME1 805 aa20.43■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.43■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 MAF1Q9H063 256 aa20.43■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.43■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 CLDND1Q9NY35 253 aa20.43■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 WDFY4Q6ZS81 3184 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 C17orf102A2RUQ5 167 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 OPLAHO14841 1288 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 PPFIA4O75335 1185 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 IQCA1Q86XH1 822 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM192Q8IY95 271 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 IL31RAQ8NI17 732 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 SEPT8Q92599 483 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 B4E1Z4 1266 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 TREHO43280 583 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 CSPG5O95196 566 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 HSD17B4P51659 736 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 SP2Q02086 613 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 CLUL1Q15846 466 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 RPAINQ86UA6 219 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 ANKS1AQ92625 1134 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 TOP1MTQ969P6 601 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 FAM50BQ9Y247 325 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 COL4A6Q14031 1691 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 POTEB3A0JP26 581 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms