RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569189.2

GGA2-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 2, human

TSL 5

Gene GGA2, Length 586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA2-215	ENST00000569189	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	SORBS3	O60504	671 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	ADCY7	P51828	1080 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	MFSD5	Q6N075	450 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	SPATA33	Q96N06	139 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	FIBP	O43427	364 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	SEMA3F	Q13275	785 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	SHH	Q15465	462 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	LRCH3	Q96II8	777 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	HIPK3	Q9H422	1215 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	SCG2	P13521	617 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	CHMP4BP1	P59074	171 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	KAT2B	Q92831	832 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	SMCO2	A6NFE2	343 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	EPHB4	P54760	987 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	NLRX1	Q86UT6	975 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	TMEM199	Q8N511	208 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GGA2-215	ENST00000569189	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	ZNF286B	P0CG31	522 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	CYP2C18	P33260	490 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	ANAPC15	P60006	121 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	27.88	■■■□□ 2.05	1e-16	■□□□□ 10.5
GGA2-215	ENST00000569189	NEDD9	Q14511	834 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	NTRK3	Q16288	839 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	PHKB	Q93100	1093 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	PPFIA4	O75335	1185 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	F2	P00734	622 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	IFNAR1	P17181	557 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	PKN1	Q16512	942 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	GPRASP2	Q96D09	838 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	CSF2RA	P15509	400 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	PSEN2	P49810	448 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	METTL7B	Q6UX53	244 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	CYP2C9	P11712	490 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	ITGB5	P18084	799 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	AP3B2	Q13367	1082 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	MFSD10	Q14728	455 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	SESTD1	Q86VW0	696 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	CDHR1	Q96JP9	859 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	PGBD1	Q96JS3	809 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	ANO3	Q9BYT9	981 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	ESYT2	A0FGR8	921 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	PPFIA3	O75145	1194 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	ALG1	Q9BT22	464 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	TMEM260	Q9NX78	707 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	NOD1	Q9Y239	953 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	HAS3	O00219	553 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	CCL23	P55773	120 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	MTMR1	Q13613	665 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	GPR153	Q6NV75	609 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	C7orf31	Q8N865	590 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	SCN5A	Q14524	2016 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GGA2-215	ENST00000569189	PTGIS	Q16647	500 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GGA2-215	ENST00000569189	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04

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