RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567909.1

GINS3-209, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene GINS3, Length 210 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-209ENST00000567909 IL27Q8NEV9 243 aa14.53□□□□□ -0.08
GINS3-209ENST00000567909 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 FIBPO43427 364 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 GGPS1O95749 300 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 MYL3P08590 195 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 MCM2P49736 904 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 CPT1AP50416 773 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 NKX3-2P78367 333 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 ARHGAP4P98171 946 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 SP2Q02086 613 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 ARHGAP1Q07960 439 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 SEMA3FQ13275 785 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 TRIM29Q14134 588 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 AFG1LQ8WV93 481 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 TMX3Q96JJ7 454 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 EVI5O60447 810 aa14.51□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 TGFB3P10600 412 aa14.51□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 ITGB5P18084 799 aa14.51□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 ICAM3P32942 547 aa14.51□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 MTMR1Q13613 665 aa14.51□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 LAMC2Q13753 1193 aa14.51□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 NPY5RQ15761 445 aa14.51□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 GALNT17Q6IS24 598 aa14.51□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa14.51□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 C7orf61Q8IZ16 206 aa14.51□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.51□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 GPRASP2Q96D09 838 aa14.51□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.51□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.51□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 JADE2Q9NQC1 790 aa14.51□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 A6NJR5 290 aa14.5□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 MMP3P08254 477 aa14.5□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 RTP1P59025 263 aa14.5□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 SP4Q02446 784 aa14.5□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 NEDD9Q14511 834 aa14.5□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 CEP55Q53EZ4 464 aa14.5□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.5□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.5□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.5□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 OXER1Q8TDS5 423 aa14.5□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 CDHR1Q96JP9 859 aa14.5□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 SPATA33Q96N06 139 aa14.5□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.5□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.5□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 CEP290O15078 2479 aa14.5□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa14.49□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 M0R2N6 131 aa14.49□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 ARP10275 920 aa14.49□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 CHMP4BP1P59074 171 aa14.49□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 GUCY1B3Q02153 619 aa14.49□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.49□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 KRT40Q6A162 431 aa14.49□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.49□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 TBCKQ8TEA7 893 aa14.49□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 UIMC1Q96RL1 719 aa14.49□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.49□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.49□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.49□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 ELP1O95163 1332 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 FAM86B1E9PN63 330 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 ATP9AO75110 1047 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 CYP3A4P08684 503 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 KRT2P35908 639 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 PSMC6P62333 389 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 DGKDQ16760 1214 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 TRIM60Q495X7 471 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 PLA2G4DQ86XP0 818 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 PPTC7Q8NI37 304 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 C8orf76Q96K31 380 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 MEIS1O00470 390 aa14.47□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 MAFGO15525 162 aa14.47□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 KPNA6O60684 536 aa14.47□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
GINS3-209ENST00000567909 CABYRO75952 493 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms