RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 PPFIA4O75335 1185 aa25.06■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.06■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 LIFRP42702 1097 aa25.06■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 KIAA0753Q2KHM9 967 aa25.06■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.06■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa25.06■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 F2P00734 622 aa25.05■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 RABGGTBP53611 331 aa25.05■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 SP2Q02086 613 aa25.05■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 HSDL1Q3SXM5 330 aa25.05■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.05■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.05■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 VWCEQ96DN2 955 aa25.05■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 PRDM12Q9H4Q4 367 aa25.05■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.05■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa25.05■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa25.04■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 STAM2O75886 525 aa25.04■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.04■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 CCDC82Q8N4S0 544 aa25.04■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.04■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 SELPP16109 830 aa25.02■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 MICU3Q86XE3 530 aa25.02■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 FANCBQ8NB91 859 aa25.02■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 NEK1Q96PY6 1258 aa25.02■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 PSTPIP2Q9H939 334 aa25.02■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa25.02■■□□□ 1.6
CIPC-208ENST00000557115 HAS3O00219 553 aa25.01■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 FIBPO43427 364 aa25.01■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 MYOGP15173 224 aa25.01■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 NEDD9Q14511 834 aa25.01■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 PPP2R2DQ66LE6 453 aa25.01■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 LRRC8DQ7L1W4 858 aa25.01■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.01■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 A0A0C4DFX4 3053 aa25■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 PIK3CDO00329 1044 aa25■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 MEIS2O14770 477 aa25■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 CDC45O75419 566 aa25■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 PTK7Q13308 1070 aa25■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 PCNX4Q63HM2 1172 aa25■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 CTAGE1Q96RT6 745 aa25■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 SLC9A7Q96T83 725 aa25■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.99■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 PARNO95453 639 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 CKBP12277 381 aa24.99■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 IGFBP4P22692 258 aa24.99■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 ICAM3P32942 547 aa24.99■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.99■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 TMTC3Q6ZXV5 915 aa24.99■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 CYFIP1Q7L576 1253 aa24.99■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 NLRX1Q86UT6 975 aa24.99■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.99■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 PPM1EQ8WY54 764 aa24.99■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.99■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 H3BRB1 525 aa24.98■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 BAIAP3O94812 1187 aa24.98■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 KCNJ6P48051 423 aa24.98■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 METTL7BQ6UX53 244 aa24.98■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.98■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa24.98■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 BCAS3Q9H6U6 928 aa24.98■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 KIF28PB7ZC32 967 aa24.97■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 SP4Q02446 784 aa24.97■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 KRT32Q14532 448 aa24.97■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.97■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.97■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 USP26Q9BXU7 913 aa24.97■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 CDH23Q9H251 3354 aa24.96■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.96■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.96■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 LGALS2P05162 132 aa24.96■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 FGD1P98174 961 aa24.96■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 RBL2Q08999 1139 aa24.96■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 ATP6V0A1Q93050 837 aa24.96■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CIPC-208ENST00000557115 SCN5AQ14524 2016 aa24.95■■□□□ 1.58
CIPC-208ENST00000557115 CA3P07451 260 aa24.95■■□□□ 1.58
CIPC-208ENST00000557115 SEMA3FQ13275 785 aa24.95■■□□□ 1.58
CIPC-208ENST00000557115 UBE2SQ16763 222 aa24.95■■□□□ 1.58
CIPC-208ENST00000557115 APOA5Q6Q788 366 aa24.95■■□□□ 1.58
CIPC-208ENST00000557115 GPR20Q99678 358 aa24.95■■□□□ 1.58
CIPC-208ENST00000557115 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CIPC-208ENST00000557115 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CIPC-208ENST00000557115 MYH7BA7E2Y1 1941 aa24.94■■□□□ 1.58
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