RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556705.5

SRP54-AS1-204, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 580 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-204ENST00000556705 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 CYP2C9P11712 490 aa15.22■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CSF2RAP15509 400 aa15.22■□□□□ 0.03
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 ICAM3P32942 547 aa15.22■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-204ENST00000556705 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 C16orf59Q7L2K0 433 aa15.22■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PPTC7Q8NI37 304 aa15.22■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-204ENST00000556705 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 HIPK3Q9H422 1215 aa15.22■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa15.22■□□□□ 0.03
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa15.21■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-204ENST00000556705 STAM2O75886 525 aa15.21■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TMEM199Q8N511 208 aa15.21■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SPATA33Q96N06 139 aa15.21■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15.21■□□□□ 0.032e-20■■□□□ 11.7
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa15.21■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-204ENST00000556705 STXBP3O00186 592 aa15.2■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa15.2■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ACRP10323 421 aa15.2■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NAPAP54920 295 aa15.2■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CCL23P55773 120 aa15.2■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 EVCP57679 992 aa15.2■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.022e-7■□□□□ 10.5
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GNPTABQ3T906 1256 aa15.2■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GPR153Q6NV75 609 aa15.2■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 XRRA1Q6P2D8 792 aa15.2■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ALG1Q9BT22 464 aa15.2■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 WNT8AQ9H1J5 351 aa15.2■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MLXIPQ9HAP2 919 aa15.2■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RIC8AQ9NPQ8 531 aa15.2■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BARHL2Q9NY43 387 aa15.2■□□□□ 0.02
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 NID2Q14112 1375 aa15.2■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa15.19■□□□□ 0.02
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 FIBPO43427 364 aa15.19■□□□□ 0.02
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF286BP0CG31 522 aa15.19■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 TMEM240Q5SV17 173 aa15.19■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 Q7L0L9 218 aa15.19■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CYFIP1Q7L576 1253 aa15.19■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SCLYQ96I15 445 aa15.19■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TM6SF1Q9BZW5 370 aa15.19■□□□□ 0.02
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa15.19■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TET1Q8NFU7 2136 aa15.19■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SMCO2A6NFE2 343 aa15.18■□□□□ 0.02
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 hCG_1984214I3L0E3 225 aa15.18■□□□□ 0.02
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 ITGB5P18084 799 aa15.18■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ADCY7P51828 1080 aa15.18■□□□□ 0.02
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 NEDD9Q14511 834 aa15.18■□□□□ 0.02
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PPP1R18Q6NYC8 613 aa15.18■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF365Q70YC5 407 aa15.18■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NLRX1Q86UT6 975 aa15.18■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SESTD1Q86VW0 696 aa15.18■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PHKBQ93100 1093 aa15.18■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PGBD1Q96JS3 809 aa15.18■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CTAGE1Q96RT6 745 aa15.18■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 C16orf70Q9BSU1 422 aa15.18■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IL23AQ9NPF7 189 aa15.18■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TMEM260Q9NX78 707 aa15.18■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.18■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa15.18■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GBF1Q92538 1859 aa15.17■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TANC1Q9C0D5 1861 aa15.17■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ADAMTS3O15072 1205 aa15.17■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ATP9AO75110 1047 aa15.17■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PPFIA3O75145 1194 aa15.17■□□□□ 0.02
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