RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 COPRSQ9NQ92 184 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 DDX19BQ9UMR2 479 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 USTQ9Y2C2 406 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 LAMA5O15230 3695 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 A0A1W2PRG0 241 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 J3QKU1 62 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 PER2O15055 1255 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 RETP07949 1114 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 MYL3P08590 195 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 TECP42680 631 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 KCNC3Q14003 757 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 DUSP6Q16828 381 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 ABCB5Q2M3G0 1257 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 ZNF384Q8TF68 577 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 CTAGE1Q96RT6 745 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 SCNM1Q9BWG6 230 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 APOL5Q9BWW9 433 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 TBC1D17Q9HA65 648 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 CABP5Q9NP86 173 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 PALD1Q9ULE6 856 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 ABCA12Q86UK0 2595 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 TK2O00142 265 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 WDR46O15213 610 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 SRGAP3O43295 1099 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 LAMTOR5O43504 91 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 C1QL1O75973 258 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 PRB1P04280 392 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 ITGB1P05556 798 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 HLA-DOAP06340 250 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 NCLP19338 710 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 CPT1AP50416 773 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 ATP8B2P98198 1209 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 MBTPS1Q14703 1052 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 TMEM63BQ5T3F8 832 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 CCDC102BQ68D86 513 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 PROSER1Q86XN7 944 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 FAM133AQ8N9E0 248 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 POF1BQ8WVV4 589 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 CYP26B1Q9NR63 512 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 RAB23Q9ULC3 237 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 COG6Q9Y2V7 657 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 EMSYQ7Z589 1322 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 VWA5AO00534 786 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 KPNA6O60684 536 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 GLULP15104 373 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 ADORA1P30542 326 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 GUCY1A2P33402 732 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 GSTO1P78417 241 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 RASGRF1Q13972 1273 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 POLA2Q14181 598 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 C20orf194Q5TEA3 1177 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 CES5AQ6NT32 575 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 TAPT1Q6NXT6 567 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 REPS2Q8NFH8 660 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 SSH3Q8TE77 659 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 ADAM7Q9H2U9 754 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 CLMPQ9H6B4 373 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 PDGFCQ9NRA1 345 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 SRPK3Q9UPE1 567 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 AKAP13Q12802 2813 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 CFHP08603 1231 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 ITIH3Q06033 890 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 CEP85Q6P2H3 762 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 SESTD1Q86VW0 696 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 ANKRD35Q8N283 1001 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 RASGRP4Q8TDF6 673 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 TEX13BQ9BXU2 312 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 CDH22Q9UJ99 828 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 AKAP2Q9Y2D5 859 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-225ENST00000551253 RIPK3Q9Y572 518 aa8.52□□□□□ -1.05
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