RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551206.5

USP15-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 1,022 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-217ENST00000551206 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USP15-217ENST00000551206 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USP15-217ENST00000551206 SCG2P13521 617 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-217ENST00000551206 RAG1P15918 1043 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-217ENST00000551206 ITGB8P26012 769 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-217ENST00000551206 BMP8BP34820 402 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-217ENST00000551206 ANAPC15P60006 121 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-217ENST00000551206 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP15-217ENST00000551206 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USP15-217ENST00000551206 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-217ENST00000551206 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-217ENST00000551206 TRPV6Q9H1D0 765 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-217ENST00000551206 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-217ENST00000551206 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-217ENST00000551206 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-217ENST00000551206 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 CPLX1O14810 134 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 TLR3O15455 904 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 GGPS1O95749 300 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 MMP3P08254 477 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 TGFB3P10600 412 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 NTRK3Q16288 839 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 PKN1Q16512 942 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 DGKDQ16760 1214 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 GNPTABQ3T906 1256 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 FAM47CQ5HY64 1035 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 PGBD1Q96JS3 809 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 SPATA33Q96N06 139 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 TMEM260Q9NX78 707 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 B4GALT4O60513 344 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 STAM2O75886 525 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 IFNAR1P17181 557 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 NLRX1Q86UT6 975 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 PPTC7Q8NI37 304 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 FIBPO43427 364 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 DTNBO60941 627 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 TIMP1P01033 207 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 CD4P01730 458 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 ITGB5P18084 799 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 ICAM3P32942 547 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 AK2P54819 239 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 SEMA3FQ13275 785 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 TBX21Q9UL17 535 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 NID2Q14112 1375 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 ADAMTS3O15072 1205 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 PPFIA4O75335 1185 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 ZNF286BP0CG31 522 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 CYP2C18P33260 490 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 NEK4P51957 841 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 SP4Q02446 784 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 NEDD9Q14511 834 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 C8orf34Q49A92 452 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 POTEGQ6S5H5 508 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 TDHQ8IZJ6 230 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 KAT2BQ92831 832 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 ALG1Q9BT22 464 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 C6orf50Q9HD87 102 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 A0A1W2PPC1 479 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 ATP9AO75110 1047 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 CYP2C9P11712 490 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 EPHB4P54760 987 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 SCRN1Q12765 414 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 MTMR1Q13613 665 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 ANKRD1Q15327 319 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 NFRKBQ6P4R8 1299 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms