RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF302Q9NR11 478 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 WDR19Q8NEZ3 1342 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 H7C4K7 107 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 TOMM70O94826 608 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 EVCP57679 992 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 DRP2Q13474 957 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 MTX1Q13505 466 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 CNGA4Q8IV77 575 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 DYDC1Q8WWB3 177 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 CRACR2AQ9BSW2 395 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRB-209ENST00000550857 RNF8O76064 485 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 SRGNP10124 158 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 SP3Q02447 781 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 MTMR1Q13613 665 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 Q3C1V9 767 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 FAM83BQ5T0W9 1011 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 LGSNQ5TDP6 509 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM169Q96HH4 297 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 PLEKHF1Q96S99 279 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 STARD7Q9NQZ5 370 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 GLTPD2A6NH11 291 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 HUS1O60921 280 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 AMHP03971 560 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 SESTD1Q86VW0 696 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 APOL6Q9BWW8 343 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 K7ERI5 159 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 TUBBP07437 444 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 RASGRF1Q13972 1273 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 PPP2R5EQ16537 467 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 SYCE1Q8N0S2 351 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 UBN1Q9NPG3 1134 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 F13A1P00488 732 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 SEPT1Q8WYJ6 367 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 MAF1Q9H063 256 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC68Q9H2F9 335 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 DYRK4Q9NR20 520 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 RALAP11233 206 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 PPIL2Q13356 520 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 GNASQ5JWF2 1037 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 NECAB2Q7Z6G3 386 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 RNF214Q8ND24 703 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 NT5C1BQ96P26 610 aa8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 RFC5P40937 340 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 PPFIA1Q13136 1202 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 PLD1Q13393 1074 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 ASIC2Q16515 512 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 GPATCH11Q8N954 259 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 THAP12O43422 761 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 PRR29P0C7W0 189 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF853P0CG23 659 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 SLC26A2P50443 739 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 SEMA3FQ13275 785 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 SNX21Q969T3 373 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 STAP2Q9UGK3 403 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 ORC4O43929 436 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 GSE1Q14687 1217 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 USP32Q8NFA0 1604 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 F5H6K3 240 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 UBE2Q2LH0YL09 131 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 GPR182O15218 404 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 SPOPO43791 374 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 KDM1AO60341 852 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 AKR1A1P14550 325 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF165P49910 485 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 ST8SIA6P61647 398 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 PTK2Q05397 1052 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 KLRC3Q07444 240 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 POLIQ9UNA4 740 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 RWDD3Q9Y3V2 267 aa8.82□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRB-209ENST00000550857 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms