RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 ZBBXA8MT70 800 aa21.61■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 PSEN2P49810 448 aa21.61■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 RABGGTBP53611 331 aa21.61■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 ANTXR2P58335 489 aa21.61■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.61■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 C7orf31Q8N865 590 aa21.61■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 SENP2Q9HC62 589 aa21.61■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.61■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.61■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.6■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 PIK3CDO00329 1044 aa21.6■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 EFCAB14O75071 495 aa21.6■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 DDAH1O94760 285 aa21.6■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 CKBP12277 381 aa21.6■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 CCND2P30279 289 aa21.6■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 MFSD10Q14728 455 aa21.6■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.6■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.6■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 XRRA1Q6P2D8 792 aa21.6■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.6■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.6■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 TMTC2Q8N394 836 aa21.6■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.6■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 THEGQ9P2T0 379 aa21.6■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.59■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 MYOGP15173 224 aa21.59■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 SP2Q02086 613 aa21.59■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.59■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 CHST3Q7LGC8 479 aa21.59■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 CATIPQ7Z7H3 387 aa21.59■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 IL31RAQ8NI17 732 aa21.59■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.59■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 SIP14410 1827 aa21.58■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 KIF28PB7ZC32 967 aa21.58■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 CA3P07451 260 aa21.58■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 KIF5BP33176 963 aa21.58■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 GNPTABQ3T906 1256 aa21.58■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 SERINC5Q86VE9 423 aa21.58■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.58■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 SPATA33Q96N06 139 aa21.58■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 ASB2Q96Q27 587 aa21.58■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 LY9Q9HBG7 655 aa21.58■■□□□ 1.05
LTBR-211ENST00000543190 EMSYQ7Z589 1322 aa21.57■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 CAND2O75155 1236 aa21.57■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 GGPS1O95749 300 aa21.57■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 WDR5P61964 334 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 TAP1Q03518 808 aa21.57■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 HOMER1Q86YM7 354 aa21.57■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.57■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 USP26Q9BXU7 913 aa21.57■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.56■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 NBNO60934 754 aa21.56■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 ZNF286BP0CG31 522 aa21.56■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 LIFRP42702 1097 aa21.56■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 NEDD9Q14511 834 aa21.56■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 METTL7BQ6UX53 244 aa21.56■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.56■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.56■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 TMEM87BQ96K49 555 aa21.56■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 KCNJ6P48051 423 aa21.55■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 GNAQP50148 359 aa21.55■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.55■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 LMCD1Q9NZU5 365 aa21.55■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 MTCH2Q9Y6C9 303 aa21.55■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 COL4A6Q14031 1691 aa21.55■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 H3BRB1 525 aa21.54■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 MEIS2O14770 477 aa21.54■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 FIBPO43427 364 aa21.54■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 GJB5O95377 273 aa21.54■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 IGFBP4P22692 258 aa21.54■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 MCM5P33992 734 aa21.54■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 MBTPS1Q14703 1052 aa21.54■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 PRDM6Q9NQX0 595 aa21.54■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 CALM1P0DP23 149 aa21.53■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 CALM2P0DP24 149 aa21.53■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 CALM3P0DP25 149 aa21.53■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 HIC1Q14526 733 aa21.53■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 NECTIN1Q15223 517 aa21.53■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.53■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.53■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 ALG1Q9BT22 464 aa21.53■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.53■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 TLL1O43897 1013 aa21.52■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 LGALS2P05162 132 aa21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms