RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, human

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STIP1-208	ENST00000540501	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		29.11	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	TCHH	Q07283	1943 aa		29.11	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		29.1	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	YEATS4	O95619	227 aa		29.1	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	CYP2C19	P33261	490 aa		29.1	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		29.1	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		29.1	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	USP28	Q96RU2	1077 aa		29.1	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		29.1	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		29.1	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		29.1	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		29.1	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	29.09	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	CALCRL	Q16602	461 aa		29.09	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		29.09	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		29.09	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	LENG9	Q96B70	501 aa		29.09	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	KATNBL1	Q9H079	304 aa		29.09	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	RGS20	O76081	388 aa		29.08	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	PRPH	P41219	470 aa		29.08	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	PTGDR	Q13258	359 aa		29.08	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	NEDD9	Q14511	834 aa		29.08	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		29.08	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		29.08	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		29.08	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		29.08	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	SLC37A4	O43826	429 aa		29.07	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	OR52Z1	P0C646	297 aa		29.07	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	NBR1	Q14596	966 aa		29.07	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	SLC39A14	Q15043	492 aa		29.07	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	STK38	Q15208	465 aa		29.07	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	POTED	Q86YR6	584 aa		29.07	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	RIT2	Q99578	217 aa		29.07	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		29.07	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		29.07	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	CLIC4	Q9Y696	253 aa		29.07	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	NFASC	O94856	1347 aa		29.06	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	WNT7A	O00755	349 aa		29.06	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	MSH4	O15457	936 aa		29.06	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	AR	P10275	920 aa		29.06	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	ELN	P15502	786 aa		29.06	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		29.06	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		29.06	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	CYBA	P13498	195 aa		29.05	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		29.05	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		29.05	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		29.05	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	SLC5A5	Q92911	643 aa		29.05	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	MTMR9	Q96QG7	549 aa		29.05	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	SDF4	Q9BRK5	362 aa		29.05	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	AKR1A1	P14550	325 aa		29.04	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	PTPA	Q15257	358 aa		29.04	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		29.04	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		29.04	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		29.04	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		29.04	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	FERMT2	Q96AC1	680 aa		29.04	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	RAB34	Q9BZG1	259 aa		29.04	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		29.04	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	SPTLC2	O15270	562 aa		29.03	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	PPP6R2	O75170	966 aa		29.03	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	SEMA3F	Q13275	785 aa		29.03	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		29.03	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		29.03	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		29.03	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		29.03	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		29.03	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		29.03	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		29.03	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501		Q9Y3F1	56 aa		29.03	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	GAS7	O60861	476 aa		29.02	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	INHA	P05111	366 aa		29.02	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	KCNA2	P16389	499 aa		29.02	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	TNFAIP2	Q03169	654 aa		29.02	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		29.02	■■■□□ 2.24
STIP1-208	ENST00000540501	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		29.02	■■■□□ 2.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms