RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 STXBP3O00186 592 aa27.77■■■□□ 2.04
PITX3-202ENST00000539804 PPFIA4O75335 1185 aa27.77■■■□□ 2.04
PITX3-202ENST00000539804 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
PITX3-202ENST00000539804 GPRASP2Q96D09 838 aa27.77■■■□□ 2.04
PITX3-202ENST00000539804 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
PITX3-202ENST00000539804 PCDHA6Q9UN73 950 aa27.77■■■□□ 2.04
PITX3-202ENST00000539804 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa27.77■■■□□ 2.04
PITX3-202ENST00000539804 DNAH12Q6ZR08 3092 aa27.76■■■□□ 2.04
PITX3-202ENST00000539804 TIMP1P01033 207 aa27.76■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 IL31RAQ8NI17 732 aa27.76■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 IL17RAQ96F46 866 aa27.76■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 SPATA33Q96N06 139 aa27.76■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 TRIM43BA6NCK2 446 aa27.75■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa27.75■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 NOP56O00567 594 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 RGS20O76081 388 aa27.75■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 GGPS1O95749 300 aa27.75■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 CD4P01730 458 aa27.75■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 MYSM1Q5VVJ2 828 aa27.75■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 TMEM199Q8N511 208 aa27.75■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 SH3GLB2Q9NR46 395 aa27.75■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 TBX21Q9UL17 535 aa27.75■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 METTL7BQ6UX53 244 aa27.74■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 BADQ92934 168 aa27.74■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 ZMYND12Q9H0C1 365 aa27.74■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 CCT2P78371 535 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 FPGSQ05932 587 aa27.73■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 UBE2SQ16763 222 aa27.73■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa27.73■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 SLC26A6Q9BXS9 759 aa27.73■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 PSMC6P62333 389 aa27.72■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP27.72■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 NTRK3Q16288 839 aa27.72■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 NBPF20Q3BBV1 942 aa27.72■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 FAM47CQ5HY64 1035 aa27.72■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 MFSD5Q6N075 450 aa27.72■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 SESTD1Q86VW0 696 aa27.72■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 RTEL1Q9NZ71 1219 aa27.72■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 DEXIO95424 95 aa27.71■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 PTGS1P23219 599 aa27.71■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 MTMR1Q13613 665 aa27.71■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 LRIT3Q3SXY7 679 aa27.71■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 CCDC155Q8N6L0 562 aa27.71■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 IL27Q8NEV9 243 aa27.71■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 NOD1Q9Y239 953 aa27.71■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 GRIN2DO15399 1336 aa27.7■■■□□ 2.03
PITX3-202ENST00000539804 XBP1P17861 261 aa27.7■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 PHKBQ93100 1093 aa27.7■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 ANO3Q9BYT9 981 aa27.7■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 C22orf23Q9BZE7 217 aa27.7■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 HIPK3Q9H422 1215 aa27.7■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 JADE2Q9NQC1 790 aa27.7■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 LTBP2Q14767 1821 aa27.69■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 GALNT17Q6IS24 598 aa27.69■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 C7orf31Q8N865 590 aa27.69■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa27.69■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa27.69■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 B4GALT4O60513 344 aa27.68■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 F2P00734 622 aa27.68■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 ZNF76P36508 570 aa27.68■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 SREBF1P36956 1147 aa27.68■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 CLK2P49760 499 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP27.68■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 SP2Q02086 613 aa27.68■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 PKN1Q16512 942 aa27.68■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 TYW1BQ6NUM6 668 aa27.68■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 GPR153Q6NV75 609 aa27.68■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 BFSP2Q13515 415 aa27.67■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 HSDL1Q3SXM5 330 aa27.67■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 CYFIP1Q7L576 1253 aa27.67■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 NIPA1Q7RTP0 329 aa27.67■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 WASF1Q92558 559 aa27.67■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 MXRA8Q9BRK3 442 aa27.67■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
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PITX3-202ENST00000539804 PSEN2P49810 448 aa27.66■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 MFSD10Q14728 455 aa27.66■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 CEP55Q53EZ4 464 aa27.66■■■□□ 2.02
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PITX3-202ENST00000539804 TRPV6Q9H1D0 765 aa27.66■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 ITGB5P18084 799 aa27.65■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 NLRP5P59047 1200 aa27.65■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 STK3Q13188 491 aa27.65■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 KIAA0753Q2KHM9 967 aa27.65■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 RETREG2Q8NC44 543 aa27.65■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 CAGE1Q8TC20 777 aa27.65■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 SDF4Q9BRK5 362 aa27.65■■■□□ 2.02
PITX3-202ENST00000539804 PITPNM1O00562 1244 aa27.64■■■□□ 2.02
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