RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 GRB10Q13322 594 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT31Q15323 416 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT79Q5XKE5 535 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 MCTP2Q6DN12 878 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 SV2BQ7L1I2 683 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 ATG4CQ96DT6 458 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 MARCH6O60337 910 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 STX10O60499 249 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 TUBB4AP04350 444 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 PBX1P40424 430 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 USP11P51784 963 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM139Q8IV31 216 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 CPXCR1Q8N123 301 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNJ18B7U540 433 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 SREBF1P36956 1147 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R2P41236 205 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGAP4P98171 946 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 PDE4DQ08499 809 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNJ12Q14500 433 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 HAS1Q92839 578 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 MBOAT7Q96N66 472 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 ELP3Q9H9T3 547 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 CSADQ9Y600 493 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 N4BP3O15049 544 aa22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP3A7P24462 503 aa22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 GJA10Q969M2 543 aa22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 POTEMA6NI47 508 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 VWA5AO00534 786 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 POLR2MP0CAP2 368 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 REPS2Q8NFH8 660 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF18AQ8NI77 898 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 PNMA5Q96PV4 448 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 NFIBO00712 420 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 ZSCAN12O43309 604 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 DSG3P32926 999 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 PANX2Q96RD6 677 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 NF2P35240 595 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 THAP9Q9H5L6 903 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 BICDL2A1A5D9 508 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 ALAS1P13196 640 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 LENG9Q96B70 501 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM47Q96LD4 638 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 UIMC1Q96RL1 719 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM86B1E9PN63 330 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 IRF6O14896 467 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBED4O75132 1171 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 TPM1P09493 284 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 RBL2Q08999 1139 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 TREML2Q5T2D2 321 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 RAD54LQ92698 747 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 VPS16Q9H269 839 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 COL20A1Q9P218 1284 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAF5O00463 557 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 HSD17B4P51659 736 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms