RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534281.1

RNF141-205, Transcript of ring finger protein 141, human

Gene RNF141, Length 5,818 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF141-205	ENST00000534281	PARVG	Q9HBI0	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	STOML1	Q9UBI4	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	TOP2B	Q02880	1626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	VILL	O15195	856 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	VAV1	P15498	845 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	S100A2	P29034	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	PAK2	Q13177	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	KLHL35	Q6PF15	583 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	GIPC2	Q8TF65	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	HDAC11	Q96DB2	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	NAPB	Q9H115	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	AZI2	Q9H6S1	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	TOPBP1	Q92547	1522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	AP3D1	O14617	1153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	MUSK	O15146	869 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	CYTH3	O43739	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	STOM	P27105	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	CASP2	P42575	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	PHKA1	P46020	1223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	PLCD1	P51178	756 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	MMRN1	Q13201	1228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	EPC2	Q52LR7	807 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	CYTH2	Q99418	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	RBBP8	Q99708	897 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	USP40	Q9NVE5	1235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	COG6	Q9Y2V7	657 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281		H7C0S8	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	GMFG	O60234	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	STAM2	O75886	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	MX1	P20591	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	GALK2	Q01415	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	SERPINI1	Q99574	410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	NACA2	Q9H009	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	PPM1B	O75688	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	GJA1	P17302	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	PGD	P52209	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	PPARD	Q03181	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	PODN	Q7Z5L7	613 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	MTMR8	Q96EF0	704 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	PRX	Q9BXM0	1461 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	ZNF879	B4DU55	563 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	DFFA	O00273	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	AREL1	O15033	823 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	PSMA3	P25788	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	ETV5	P41161	510 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	AP1S1	P61966	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	CDC16	Q13042	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	RASA3	Q14644	834 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	WASHC4	Q2M389	1173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF141-205	ENST00000534281	TRIM50	Q86XT4	487 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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