RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.52■■□□□ 1.04
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PTPRU-211ENST00000531385 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 SMCO2A6NFE2 343 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-211ENST00000531385 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-211ENST00000531385 CD4P01730 458 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF286BP0CG31 522 aa21.51■■□□□ 1.03
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PTPRU-211ENST00000531385 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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PTPRU-211ENST00000531385 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-211ENST00000531385 KAT2BQ92831 832 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-211ENST00000531385 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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PTPRU-211ENST00000531385 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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PTPRU-211ENST00000531385 C8orf34Q49A92 452 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-211ENST00000531385 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-211ENST00000531385 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-211ENST00000531385 PPTC7Q8NI37 304 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTPRU-211ENST00000531385 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRU-211ENST00000531385 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.48■■□□□ 1.03
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PTPRU-211ENST00000531385 TIMP1P01033 207 aa21.48■■□□□ 1.03
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PTPRU-211ENST00000531385 CYP2C18P33260 490 aa21.48■■□□□ 1.03
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PTPRU-211ENST00000531385 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRU-211ENST00000531385 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRU-211ENST00000531385 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRU-211ENST00000531385 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRU-211ENST00000531385 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.47■■□□□ 1.03
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PTPRU-211ENST00000531385 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRU-211ENST00000531385 ALG1Q9BT22 464 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRU-211ENST00000531385 HIPK3Q9H422 1215 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRU-211ENST00000531385 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.46■■□□□ 1.03
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PTPRU-211ENST00000531385 PSEN2P49810 448 aa21.45■■□□□ 1.02
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PTPRU-211ENST00000531385 SCRN1Q12765 414 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 NLRX1Q86UT6 975 aa21.45■■□□□ 1.02
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PTPRU-211ENST00000531385 KCNA2P16389 499 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 AP3B2Q13367 1082 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 NEDD9Q14511 834 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 MFSD5Q6N075 450 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 GPR20Q99678 358 aa21.43■■□□□ 1.02
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