RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 KCTD16Q68DU8 428 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 ARMC9Q7Z3E5 817 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 MAATS1Q7Z4T9 603 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 CD302Q8IX05 232 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 SYCP3Q8IZU3 236 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 FANCBQ8NB91 859 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 C17orf50Q8WW18 174 aa9.31□□□□□ -0.92
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TRPS1-209ENST00000519674 ZIM3Q96PE6 472 aa9.31□□□□□ -0.92
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TRPS1-209ENST00000519674 GSTA1P08263 222 aa9.31□□□□□ -0.92
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TRPS1-209ENST00000519674 PPP1R7Q15435 360 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 MFSD4BQ5TF39 518 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9.31□□□□□ -0.92
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TRPS1-209ENST00000519674 WASF1Q92558 559 aa9.31□□□□□ -0.92
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TRPS1-209ENST00000519674 MAP3K14Q99558 947 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 SLC12A4Q9UP95 1085 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 SAR1BQ9Y6B6 198 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.31□□□□□ -0.92
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TRPS1-209ENST00000519674 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.31□□□□□ -0.92
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TRPS1-209ENST00000519674 CCND1P24385 295 aa9.31□□□□□ -0.92
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TRPS1-209ENST00000519674 SLC35B4Q969S0 331 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 DUOX1Q9NRD9 1551 aa9.3□□□□□ -0.92
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TRPS1-209ENST00000519674 USP17L21D6R901 530 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 DEXIO95424 95 aa9.3□□□□□ -0.92
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TRPS1-209ENST00000519674 SEC23AQ15436 765 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa9.3□□□□□ -0.92
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TRPS1-209ENST00000519674 PANK4Q9NVE7 773 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 NUB1Q9Y5A7 615 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 GMEB1Q9Y692 573 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 NHSQ6T4R5 1651 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 A0A1B0GTH6 734 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.3□□□□□ -0.92
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TRPS1-209ENST00000519674 MFAP3LO75121 409 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 PPP6R2O75170 966 aa9.3□□□□□ -0.92
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TRPS1-209ENST00000519674 RFC4P35249 363 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 MXRA7P84157 204 aa9.3□□□□□ -0.92
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TRPS1-209ENST00000519674 BRIP1Q9BX63 1249 aa9.3□□□□□ -0.92
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TRPS1-209ENST00000519674 CCDC15Q0P6D6 951 aa9.29□□□□□ -0.92
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TRPS1-209ENST00000519674 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 ANO7Q6IWH7 933 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 MMGT1Q8N4V1 131 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 IFT43Q96FT9 208 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 MTA3Q9BTC8 594 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 TAF1LQ8IZX4 1826 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 MYBL1P10243 752 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 TM4SF1P30408 202 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 PBX1P40424 430 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-209ENST00000519674 TUBP50607 506 aa9.29□□□□□ -0.92
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