RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517488.1

PDGFRB-202, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 822 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-202ENST00000517488 RIC8AQ9NPQ8 531 aa16.19■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 BARHL2Q9NY43 387 aa16.19■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 PCDHA6Q9UN73 950 aa16.19■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa16.19■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 STAM2O75886 525 aa16.18■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 CYP2C18P33260 490 aa16.18■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 CHMP4BP1P59074 171 aa16.18■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 CCT2P78371 535 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 FPGSQ05932 587 aa16.18■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.18■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 GNPTABQ3T906 1256 aa16.18■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM47CQ5HY64 1035 aa16.18■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 MFSD5Q6N075 450 aa16.18■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 PPP1R18Q6NYC8 613 aa16.18■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 XRRA1Q6P2D8 792 aa16.18■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 PHKBQ93100 1093 aa16.18■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 SPATA33Q96N06 139 aa16.18■□□□□ 0.18
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PDGFRB-202ENST00000517488 SMCO2A6NFE2 343 aa16.17■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 SPDYE3A6NKU9 549 aa16.17■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 FIBPO43427 364 aa16.17■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF286BP0CG31 522 aa16.17■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 CYP2C9P11712 490 aa16.17■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 SCG2P13521 617 aa16.17■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 ITGB5P18084 799 aa16.17■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 ADCY7P51828 1080 aa16.17■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 NTRK3Q16288 839 aa16.17■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 PKN1Q16512 942 aa16.17■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 NFRKBQ6P4R8 1299 aa16.17■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 PGBD1Q96JS3 809 aa16.17■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 HIPK3Q9H422 1215 aa16.17■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 MLXIPQ9HAP2 919 aa16.17■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 PDRG1Q9NUG6 133 aa16.17■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 hCG_1984214I3L0E3 225 aa16.16■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 SEC24BO95487 1268 aa16.16■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 CSF2RAP15509 400 aa16.16■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 C16orf59Q7L2K0 433 aa16.16■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 CYFIP1Q7L576 1253 aa16.16■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 TMEM260Q9NX78 707 aa16.16■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 TELO2Q9Y4R8 837 aa16.16■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 LTBP2Q14767 1821 aa16.16■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 ADAMTS3O15072 1205 aa16.15■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 PPFIA4O75335 1185 aa16.15■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 F2P00734 622 aa16.15■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa16.15■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 IFNAR1P17181 557 aa16.15■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 PSEN2P49810 448 aa16.15■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 CCL23P55773 120 aa16.15■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 NEDD9Q14511 834 aa16.15■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 METTL7BQ6UX53 244 aa16.15■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 NLRX1Q86UT6 975 aa16.15■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 SLC26A6Q9BXS9 759 aa16.15■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 WNT8AQ9H1J5 351 aa16.15■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa16.15■□□□□ 0.18
PDGFRB-202ENST00000517488 HAS3O00219 553 aa16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 ATP9AO75110 1047 aa16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 ACRP10323 421 aa16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 CLK2P49760 499 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 ANAPC15P60006 121 aa16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 STK3Q13188 491 aa16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 MFSD10Q14728 455 aa16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 SESTD1Q86VW0 696 aa16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 TEX2Q8IWB9 1127 aa16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 TMEM199Q8N511 208 aa16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 GPRASP2Q96D09 838 aa16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 CTAGE1Q96RT6 745 aa16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 SENP7Q9BQF6 1050 aa16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 C16orf70Q9BSU1 422 aa16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 ALG1Q9BT22 464 aa16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 ANO3Q9BYT9 981 aa16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 JADE2Q9NQC1 790 aa16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 HDAC6Q9UBN7 1215 aa16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa16.14■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 FOSP01100 380 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 KCNA2P16389 499 aa16.13■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 SP4Q02446 784 aa16.13■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 KIAA0753Q2KHM9 967 aa16.13■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 TMEM240Q5SV17 173 aa16.13■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa16.13■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 CYP2W1Q8TAV3 490 aa16.13■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 GPR20Q99678 358 aa16.13■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 KATNAL1Q9BW62 490 aa16.13■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 ZMYND12Q9H0C1 365 aa16.13■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 GLT8D2Q9H1C3 349 aa16.13■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 EHMT1Q9H9B1 1298 aa16.13■□□□□ 0.17
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