RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496043.5

PTPRF-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRF, Length 415 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-214ENST00000496043 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 MYLIPQ8WY64 445 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 ZBBXA8MT70 800 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 HAS3O00219 553 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 MEIS2O14770 477 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 SORBS3O60504 671 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 ICAM3P32942 547 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 PBX2P40425 430 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 NEDD9Q14511 834 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 KRT32Q14532 448 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 MFSD10Q14728 455 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 GRIN2CQ14957 1233 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 CAGE1Q8TC20 777 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 VWCEQ96DN2 955 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 FOSL2P15408 326 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 NLRX1Q86UT6 975 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 RASEFQ8IZ41 740 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 FIBPO43427 364 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 F2P00734 622 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 ZNF286BP0CG31 522 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 PTK7Q13308 1070 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 MICU3Q86XE3 530 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 USP26Q9BXU7 913 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 H3BRB1 525 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 DLL1O00548 723 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 ZBTB43O43298 467 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 SELPP16109 830 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 APOA5Q6Q788 366 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 METTL7BQ6UX53 244 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 CKBP12277 381 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 RABGGTBP53611 331 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 FGD1P98174 961 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 RBL2Q08999 1139 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 SEMA3FQ13275 785 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 RTN1Q16799 776 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 CDHR1Q96JP9 859 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 TCEANC2Q96MN5 208 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 KIF28PB7ZC32 967 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 MAFGO15525 162 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 LGALS2P05162 132 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 LRRC8DQ7L1W4 858 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 KCNB2Q92953 911 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 GPRASP2Q96D09 838 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 GPR20Q99678 358 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.62□□□□□ -0.07
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