RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495879.1

PTPRG-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRG, Length 3,011 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-207ENST00000495879 MCTP2Q6DN12 878 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 IQCKQ8N0W5 287 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 A0A087X0T9 212 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 KIAA0754O94854 1291 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 FAM228BP0C875 321 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 NR1D1P20393 614 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 PRPHP41219 470 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 SOGA3Q5TF21 947 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 NAA35Q5VZE5 725 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 PRLRP16471 622 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 IFT88Q13099 833 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 CAVIN3Q969G5 261 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 PLAAQ9Y263 795 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 ATP2C2O75185 946 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 CALCRLQ16602 461 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 ITGB4P16144 1822 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 DCCP43146 1447 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 E7EVH7 732 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 NOL4O94818 638 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 SBK1Q52WX2 424 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 AK8Q96MA6 479 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 CUEDC2Q9H467 287 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 KCNQ2O43526 872 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 ACTN1P12814 892 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 SKOR1P84550 965 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 C6orf50Q9HD87 102 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 KCNK3O14649 394 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 LCA5LO95447 670 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 GNAQP50148 359 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 PAK2Q13177 524 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 UNC13DQ70J99 1090 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 GDF3Q9NR23 364 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRG-207ENST00000495879 LAD1O00515 517 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 TNNI2P48788 182 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 UBE2SQ16763 222 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 USP17L5A8MUK1 530 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 RASA1P20936 1047 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 TMOD1P28289 359 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 ITIH3Q06033 890 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 CD248Q9HCU0 757 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 CCT8L2Q96SF2 557 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 PJA2O43164 708 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 CEP104O60308 925 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 PPP1R37O75864 691 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 FLT3P36888 993 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 ERVK-9P63128 1117 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 PTGISQ16647 500 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 CHADLQ6NUI6 762 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 KLHL30Q0D2K2 578 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 NLRP14Q86W24 1093 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 EYA3Q99504 573 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 EPN3Q9H201 632 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 MAGEF1Q9HAY2 307 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 EDIL3O43854 480 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 MARCH6O60337 910 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 RAD54LQ92698 747 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 E9PMD0 336 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 SPRED3Q2MJR0 410 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 KDM7AQ6ZMT4 941 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 TSG101Q99816 390 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms