RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492400.5

ASS1-209, Transcript of argininosuccinate synthase 1, human

TSL 3

Gene ASS1, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ASS1-209	ENST00000492400	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	ICAM3	P32942	547 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	ADCY7	P51828	1080 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	FIBP	O43427	364 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	B4GALT4	O60513	344 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	PPFIA4	O75335	1185 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	GGPS1	O95749	300 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	SCG2	P13521	617 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	ANAPC15	P60006	121 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	SP2	Q02086	613 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	NEDD9	Q14511	834 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	UBE2S	Q16763	222 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	SPATA33	Q96N06	139 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	HIPK3	Q9H422	1215 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	F2	P00734	622 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	SEMA3F	Q13275	785 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	SHH	Q15465	462 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	GPR153	Q6NV75	609 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	NLRX1	Q86UT6	975 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	TMEM199	Q8N511	208 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	KAT2B	Q92831	832 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	GPRASP2	Q96D09	838 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	ESYT2	A0FGR8	921 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	SMCO2	A6NFE2	343 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	IFNAR1	P17181	557 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	ITGB5	P18084	799 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	CYP2C18	P33260	490 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	EPHB4	P54760	987 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	AP3B2	Q13367	1082 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	NTRK3	Q16288	839 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	METTL7B	Q6UX53	244 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	LRCH3	Q96II8	777 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
ASS1-209	ENST00000492400	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	SORBS3	O60504	671 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	CSF2RA	P15509	400 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	PSEN2	P49810	448 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	CHMP4BP1	P59074	171 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	MFSD10	Q14728	455 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	PKN1	Q16512	942 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	MCTP2	Q6DN12	878 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	POTEH	Q6S545	545 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	PHKB	Q93100	1093 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	ANO3	Q9BYT9	981 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	NOD1	Q9Y239	953 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	HAS3	O00219	553 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	PITPNM1	O00562	1244 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	CPLX1	O14810	134 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	MAFG	O15525	162 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	CYP2C9	P11712	490 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	MTMR1	Q13613	665 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ASS1-209	ENST00000492400	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.13	□□□□□ -0.31

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