RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-208ENST00000490302 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 MBTPS1Q14703 1052 aa20.24■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.24■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 SPATA33Q96N06 139 aa20.24■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.24■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.24■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 INSL6Q9Y581 213 aa20.24■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 EMSYQ7Z589 1322 aa20.23■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.23■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 OPLAHO14841 1288 aa20.23■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 SORBS3O60504 671 aa20.23■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 AMHP03971 560 aa20.23■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 GHRHRQ02643 423 aa20.23■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.23■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.23■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 KRT23Q9C075 422 aa20.23■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.22■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 GPR37L1O60883 481 aa20.22■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 RGS20O76081 388 aa20.22■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 GGPS1O95749 300 aa20.22■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 RSPH10BP0C881 870 aa20.22■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 THPOP40225 353 aa20.22■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 HIC1Q14526 733 aa20.22■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.22■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.22■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.22■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.22■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.22■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 TRANK1O15050 2925 aa20.22■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.21■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 PGM5Q15124 567 aa20.21■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 LEXMQ3ZCV2 418 aa20.21■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.21■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 SERINC5Q86VE9 423 aa20.21■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.21■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.21■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.21■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.21■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.21■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 CD320Q9NPF0 282 aa20.21■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.21■□□□□ 0.83
PKDCC-208ENST00000490302 C17orf102A2RUQ5 167 aa20.2■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 KLRF2D3W0D1 207 aa20.2■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.2■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 HIP1O00291 1037 aa20.2■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 ZBTB5O15062 677 aa20.2■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.2■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 MTMR8Q96EF0 704 aa20.2■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.2■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.2■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.2■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.2■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 LAMA4Q16363 1823 aa20.2■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 TGFB3P10600 412 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 KCNA5P22460 613 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 SP2Q02086 613 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 SMC5Q8IY18 1101 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 ATP6V0A1Q93050 837 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 NCOR1O75376 2440 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 CCND2P30279 289 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 IL31RAQ8NI17 732 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 SAMD11Q96NU1 681 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 SIP14410 1827 aa20.18■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 H3BRB1 525 aa20.18■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 POLR2MP0CAP2 368 aa20.18■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 TRAF1Q13077 416 aa20.18■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 PTPROQ16827 1216 aa20.18■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.18■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 GJD3Q8N144 294 aa20.18■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 SEPT8Q92599 483 aa20.18■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.17■□□□□ 0.82
PKDCC-208ENST00000490302 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.17■□□□□ 0.82
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