RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 TGM1P22735 817 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 LDLRAD1Q5T700 205 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 MROH9Q5TGP6 573 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 SLFN13Q68D06 897 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 NLRP10Q86W26 655 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 Q8TCH9 128 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 TMEM169Q96HH4 297 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 LRRC37BQ96QE4 947 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 EMC9Q9Y3B6 208 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 ECI1P42126 302 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 NFATC3Q12968 1075 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 NRN1LQ496H8 165 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 PKN3Q6P5Z2 889 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 POMZP3Q6PJE2 187 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 VHLLQ6RSH7 139 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 TEPPQ6URK8 271 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 KLHL36Q8N4N3 616 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 BVESQ8NE79 360 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 FRS2Q8WU20 508 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 CSRNP2Q9H175 543 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 DTLQ9NZJ0 730 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 FBXL7Q9UJT9 491 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 HGSO14964 777 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 MYO1BO43795 1136 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 TGFB2P61812 414 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 RACK1P63244 317 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 FANCCQ00597 558 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 PAK2Q13177 524 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 HS1BP3Q53T59 392 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 STEAP3Q658P3 488 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 GPR155Q7Z3F1 870 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 RIOX2Q8IUF8 465 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 CCDC103Q8IW40 242 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 NUDT10Q8NFP7 164 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 DIO2Q92813 273 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 NUDT11Q96G61 164 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 ADOQ96SZ5 270 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 APBA2Q99767 749 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 TCRBV5S2A0A599 114 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 CYP7B1O75881 506 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 NPLOC4Q8TAT6 608 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 BTN2A2Q8WVV5 523 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 TMEM209Q96SK2 561 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 BACH2Q9BYV9 841 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 WASF3Q9UPY6 502 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 ZNF652Q9Y2D9 606 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 FOXS1O43638 330 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 ZNF202O95125 648 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 LRG1P02750 347 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 GIPRP48546 466 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 RBM10P98175 930 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 TRIM59Q8IWR1 403 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 CPLX3Q8WVH0 158 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 LMF1Q96S06 567 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 SEMA4AQ9H3S1 761 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 CYP26B1Q9NR63 512 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 X6R8D5 127 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 TBX1O43435 398 aa5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 DGCR2P98153 550 aa5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 CYP4F3Q08477 520 aa5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 ABHD18Q0P651 414 aa5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 FOXE3Q13461 319 aa5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 CHRNA2Q15822 529 aa5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 PRSS53Q2L4Q9 553 aa5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 IQCEQ6IPM2 695 aa5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 TCTN3Q6NUS6 607 aa5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 RNF207Q6ZRF8 634 aa5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 CHFRQ96EP1 664 aa5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 WRNIP1Q96S55 665 aa5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 CLDND1Q9NY35 253 aa5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 MYOTQ9UBF9 498 aa5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 TESMINQ9Y4I5 508 aa5.11□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 ARNTLO00327 626 aa5.1□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 LCP1P13796 627 aa5.1□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 KCNJ6P48051 423 aa5.1□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 GLRBP48167 497 aa5.1□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 SOX9P48436 509 aa5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms