RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 EPHB3P54753 998 aa8.95□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 LINC00310P59036 64 aa8.95□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 AMIGO3Q86WK7 504 aa8.95□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.95□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 SMOC1Q9H4F8 434 aa8.95□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 SLC6A20Q9NP91 592 aa8.95□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 PALD1Q9ULE6 856 aa8.95□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.95□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 TADA3O75528 432 aa8.94□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 PMLP29590 882 aa8.94□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 GUCY1A3Q02108 690 aa8.94□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 TRIM61Q5EBN2 209 aa8.94□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.94□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.94□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 PANK1Q8TE04 598 aa8.94□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.94□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 JAM3Q9BX67 310 aa8.94□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.94□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 ASXL2Q76L83 1435 aa8.94□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 GNAT1P11488 350 aa8.93□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 NCKAP1LP55160 1127 aa8.93□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.93□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.93□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 PIF1Q9H611 641 aa8.93□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.93□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 WNT9AO14904 365 aa8.92□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 PLD2O14939 933 aa8.92□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 KCNQ2O43526 872 aa8.92□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 CNKSR3Q6P9H4 555 aa8.92□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 OTOP3Q7RTS5 596 aa8.92□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa8.92□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 MIB1Q86YT6 1006 aa8.92□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 DDX11Q96FC9 970 aa8.92□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.92□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 NUAK1O60285 661 aa8.91□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 FOXO4P98177 505 aa8.91□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 CAP1Q01518 475 aa8.91□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 GSTCDQ8NEC7 633 aa8.91□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 FBXW5Q969U6 566 aa8.91□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 KCNJ15Q99712 375 aa8.91□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 TMEM260Q9NX78 707 aa8.91□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 MYOTQ9UBF9 498 aa8.91□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.91□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa8.91□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.91□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 ARVCFO00192 962 aa8.9□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 ATF2P15336 505 aa8.9□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 PI3P19957 117 aa8.9□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 FAM47CQ5HY64 1035 aa8.9□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 FAM129CQ86XR2 697 aa8.9□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 HOMER1Q86YM7 354 aa8.9□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 FAM126BQ8IXS8 530 aa8.9□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.9□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.9□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 IPPKQ9H8X2 491 aa8.9□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
USP34-216ENST00000487547 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 TCRBV5S2A0A599 114 aa8.89□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 CRTAMO95727 393 aa8.89□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 CYP2C8P10632 490 aa8.89□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 CFPP27918 469 aa8.89□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 ST5P78524 1137 aa8.89□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 SQSTM1Q13501 440 aa8.89□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 SSPNQ14714 243 aa8.89□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 TCERG1LQ5VWI1 586 aa8.89□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 C16orf59Q7L2K0 433 aa8.89□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 SIAH1Q8IUQ4 282 aa8.89□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.89□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 BCAS3Q9H6U6 928 aa8.89□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 SLC52A2Q9HAB3 445 aa8.89□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa8.89□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 NPTXRO95502 500 aa8.88□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 NKX3-2P78367 333 aa8.88□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.88□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 PWWP2AQ96N64 755 aa8.88□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 ASH2LQ9UBL3 628 aa8.88□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 DSEQ9UL01 958 aa8.88□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 TCEA2Q15560 299 aa8.87□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 CRY1Q16526 586 aa8.87□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 CD300LDQ6UXZ3 194 aa8.87□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 EP400NLQ6ZTU2 488 aa8.87□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 TTLL11Q8NHH1 800 aa8.87□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.87□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 APPBP2Q92624 585 aa8.87□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
USP34-216ENST00000487547 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms