RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 ANTXR2P58335 489 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 TMEM87BQ96K49 555 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 STAM2O75886 525 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 BAIAP3O94812 1187 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 F2P00734 622 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 CALM1P0DP23 149 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 CALM2P0DP24 149 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 CALM3P0DP25 149 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 LY9Q9HBG7 655 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 MYOGP15173 224 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 SMARCA1P28370 1054 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 IL31RAQ8NI17 732 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 MYL10Q9BUA6 226 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 RGS20O76081 388 aa23.25■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 PTK7Q13308 1070 aa23.25■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.25■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 VWCEQ96DN2 955 aa23.25■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.25■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 HAS3O00219 553 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 CKBP12277 381 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 NEDD9Q14511 834 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 RNF20Q5VTR2 975 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 USP38Q8NB14 1042 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 SLC27A2O14975 620 aa23.23■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 CA3P07451 260 aa23.23■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.23■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.23■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 MYO9BQ13459 2157 aa23.23■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 FIBPO43427 364 aa23.22■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 SP2Q02086 613 aa23.22■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.22■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.22■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 NLRX1Q86UT6 975 aa23.22■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.22■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 H3BRB1 525 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 TLL1O43897 1013 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 LIFRP42702 1097 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 RBL2Q08999 1139 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 ADGRE1Q14246 886 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 TJAP1Q5JTD0 557 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 IL27Q8NEV9 243 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 THEGQ9P2T0 379 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-212ENST00000484841 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 EFCAB14O75071 495 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 RXRAP19793 462 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 ICAM3P32942 547 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 IKBKEQ14164 716 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 METTL7BQ6UX53 244 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 USP26Q9BXU7 913 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 DOCK5Q9H7D0 1870 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 PIK3CDO00329 1044 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 LGALS2P05162 132 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 GNAT1P11488 350 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 THPOP40225 353 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 NECTIN1Q15223 517 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 TET1Q8NFU7 2136 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 CERS4Q9HA82 394 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 EMSYQ7Z589 1322 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 NBNO60934 754 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 WDR5P61964 334 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
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