RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482651.5

HDGF-208, Transcript of heparin binding growth factor, human

TSL 3

Gene HDGF, Length 966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDGF-208	ENST00000482651	PRC1	O43663	620 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	ZEB2	O60315	1214 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	CABYR	O75952	493 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	HSPA4	P34932	840 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	SERPINB4	P48594	390 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	CDK7	P50613	346 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	ANAPC15	P60006	121 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	TBC1D5	Q92609	795 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	LY9	Q9HBG7	655 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	ARVCF	O00192	962 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	PIK3CD	O00329	1044 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79	6e-7	■■□□□ 13.2
HDGF-208	ENST00000482651	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	DDAH1	O94760	285 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	SEC24B	O95487	1268 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	PTGS1	P23219	599 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	MCM5	P33992	734 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	HSD17B4	P51659	736 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	GHRHR	Q02643	423 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	FAAP100	Q0VG06	881 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	TRAF1	Q13077	416 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	BECN1	Q14457	450 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	PPP2R5B	Q15173	497 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	SCFD2	Q8WU76	684 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	BAD	Q92934	168 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	TMEM87B	Q96K49	555 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	MAP3K14	Q99558	947 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	COL20A1	Q9P218	1284 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	OPLAH	O14841	1288 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	CYTH3	O43739	400 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	CFB	P00751	764 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	RAG1	P15918	1043 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	ITGB8	P26012	769 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	CPT1A	P50416	773 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	FGD1	P98174	961 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	GUCA2A	Q02747	115 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	GPR153	Q6NV75	609 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	HOMER1	Q86YM7	354 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	TMTC2	Q8N394	836 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	LRCH3	Q96II8	777 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	NEK1	Q96PY6	1258 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	PIGS	Q96S52	555 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	IWS1	Q96ST2	819 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	RMDN3	Q96TC7	470 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	TBX21	Q9UL17	535 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	LAMA3	Q16787	3333 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	CCDC69	A6NI79	296 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	C3orf80	F5H4A9	247 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	HOXA2	O43364	376 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	KIF5B	P33176	963 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	LIFR	P42702	1097 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	GNAQ	P50148	359 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	FOSB	P53539	338 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	ITGA7	Q13683	1181 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	TTLL4	Q14679	1199 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	STXBP2	Q15833	593 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	TSC1	Q92574	1164 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	KCNB2	Q92953	911 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	HLA-C	Q95604	372 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	MYL10	Q9BUA6	226 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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