RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471266.5

MFSD1-208, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene MFSD1, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-208ENST00000471266 STAM2O75886 525 aa21.53■■□□□ 1.04
MFSD1-208ENST00000471266 F2P00734 622 aa21.53■■□□□ 1.04
MFSD1-208ENST00000471266 ZNF286BP0CG31 522 aa21.53■■□□□ 1.04
MFSD1-208ENST00000471266 MFSD10Q14728 455 aa21.53■■□□□ 1.04
MFSD1-208ENST00000471266 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.53■■□□□ 1.04
MFSD1-208ENST00000471266 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.53■■□□□ 1.04
MFSD1-208ENST00000471266 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.53■■□□□ 1.04
MFSD1-208ENST00000471266 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
MFSD1-208ENST00000471266 RABGGTBP53611 331 aa21.52■■□□□ 1.04
MFSD1-208ENST00000471266 SP2Q02086 613 aa21.52■■□□□ 1.04
MFSD1-208ENST00000471266 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.52■■□□□ 1.04
MFSD1-208ENST00000471266 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.52■■□□□ 1.04
MFSD1-208ENST00000471266 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
MFSD1-208ENST00000471266 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.52■■□□□ 1.04
MFSD1-208ENST00000471266 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
MFSD1-208ENST00000471266 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.52■■□□□ 1.04
MFSD1-208ENST00000471266 HAS3O00219 553 aa21.51■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.51■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.51■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 SELPP16109 830 aa21.5■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 RXRAP19793 462 aa21.5■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 NEDD9Q14511 834 aa21.5■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 PPP2R2DQ66LE6 453 aa21.5■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.5■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.5■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 SLC9A7Q96T83 725 aa21.5■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.5■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.5■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.5■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 PIK3CDO00329 1044 aa21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 FIBPO43427 364 aa21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 ICAM3P32942 547 aa21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 PTK7Q13308 1070 aa21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 XRRA1Q6P2D8 792 aa21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 FANCBQ8NB91 859 aa21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 KIF28PB7ZC32 967 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 BAIAP3O94812 1187 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 RBL2Q08999 1139 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 SKAP1Q86WV1 359 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 NEK1Q96PY6 1258 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 H3BRB1 525 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 MEIS2O14770 477 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 CKBP12277 381 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 MYOGP15173 224 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 IGFBP4P22692 258 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 KCNJ6P48051 423 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 METTL7BQ6UX53 244 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 NLRX1Q86UT6 975 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 MICU3Q86XE3 530 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 USP26Q9BXU7 913 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 A0A0C4DFX4 3053 aa21.46■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 CDC45O75419 566 aa21.46■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.46■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.46■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 PPM1EQ8WY54 764 aa21.46■■□□□ 1.03
MFSD1-208ENST00000471266 LGALS2P05162 132 aa21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 CA3P07451 260 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 SEMA3FQ13275 785 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 ADGRE1Q14246 886 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 USP38Q8NB14 1042 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 CDHR1Q96JP9 859 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 SCN5AQ14524 2016 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 CDH23Q9H251 3354 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.43■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 CXCL10P02778 98 aa21.43■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 KRT32Q14532 448 aa21.43■■□□□ 1.02
MFSD1-208ENST00000471266 GPNMBQ14956 572 aa21.43■■□□□ 1.02
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